RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa30.79■■■□□ 2.52
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PTPRD-210ENST00000481079 IGKV5-2P06315 115 aa30.77■■■□□ 2.52
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PTPRD-210ENST00000481079 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
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PTPRD-210ENST00000481079 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
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PTPRD-210ENST00000481079 CDHR2Q9BYE9 1310 aa30.7■■■□□ 2.5
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PTPRD-210ENST00000481079 E9PSI1 815 aa30.56■■■□□ 2.48
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PTPRD-210ENST00000481079 SPEF2Q9C093 1822 aa30.5■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 PASKQ96RG2 1323 aa30.49■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 RIMBP2O15034 1052 aa30.49■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 RAD17O75943 681 aa30.49■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 CSF1RP07333 972 aa30.49■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 CIAPIN1Q6FI81 312 aa30.49■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
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