RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471978.5

C9orf3-213, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 478 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-213ENST00000471978 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
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C9orf3-213ENST00000471978 CHMP4AQ9BY43 222 aa29.12■■■□□ 2.25
C9orf3-213ENST00000471978 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa29.11■■■□□ 2.25
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C9orf3-213ENST00000471978 SCNN1DP51172 638 aa29.11■■■□□ 2.25
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C9orf3-213ENST00000471978 TAF1P21675 1872 aa29.1■■■□□ 2.25
C9orf3-213ENST00000471978 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
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C9orf3-213ENST00000471978 CCDC27Q2M243 656 aa29.09■■■□□ 2.25
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C9orf3-213ENST00000471978 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
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C9orf3-213ENST00000471978 CIAPIN1Q6FI81 312 aa29.02■■■□□ 2.24
C9orf3-213ENST00000471978 CNTNAP1P78357 1384 aa29.01■■■□□ 2.24
C9orf3-213ENST00000471978 RAD17O75943 681 aa29.01■■■□□ 2.23
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C9orf3-213ENST00000471978 COL4A1P02462 1669 aa29■■■□□ 2.23
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C9orf3-213ENST00000471978 TNIP1Q15025 636 aa29■■■□□ 2.23
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C9orf3-213ENST00000471978 G2E3Q7L622 706 aa28.93■■■□□ 2.22
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C9orf3-213ENST00000471978 DOK7Q18PE1 504 aa28.9■■■□□ 2.22
C9orf3-213ENST00000471978 WDR63Q8IWG1 891 aa28.9■■■□□ 2.22
C9orf3-213ENST00000471978 PSMD14O00487 310 aa28.89■■■□□ 2.22
C9orf3-213ENST00000471978 ECE2O60344 883 aa28.89■■■□□ 2.22
C9orf3-213ENST00000471978 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
C9orf3-213ENST00000471978 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
C9orf3-213ENST00000471978 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
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