RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 TAF1P21675 1872 aa25.34■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.34■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 GCKRQ14397 625 aa25.33■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 SLC51AQ86UW1 340 aa25.33■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CTPS1-206ENST00000470271 H7C1W4 665 aa25.32■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 TMC4Q7Z404 712 aa25.32■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 SP8Q8IXZ3 490 aa25.32■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.32■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.31■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.31■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 GLTPD2A6NH11 291 aa25.3■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.3■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 BEND3Q5T5X7 828 aa25.3■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.3■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 KIF3CO14782 793 aa25.28■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 CTSWP56202 376 aa25.28■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.28■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.28■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.27■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.27■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 PTPRCP08575 1304 aa25.27■■□□□ 1.64
CTPS1-206ENST00000470271 MYH3P11055 1940 aa25.26■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 CASP7P55210 303 aa25.26■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 C1QTNF8P60827 252 aa25.26■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 MPNDQ8N594 471 aa25.26■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.26■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.25■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.25■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.25■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 COL4A1P02462 1669 aa25.25■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.24■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 JDP2Q8WYK2 163 aa25.24■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.24■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 RRAGCQ9HB90 399 aa25.24■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 ALDH1L1O75891 902 aa25.23■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.23■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 VPS33BQ9H267 617 aa25.23■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 PPIP5K2O43314 1243 aa25.22■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 GREM2Q9H772 168 aa25.22■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 RTL9Q8NET4 1388 aa25.21■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 FZD9O00144 591 aa25.21■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 GRM8O00222 908 aa25.21■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.21■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CTPS1-206ENST00000470271 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 AOC3Q16853 763 aa25.2■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 COL4A5P29400 1685 aa25.2■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.19■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.18■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 WDR90Q96KV7 1748 aa25.18■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 TOMM70O94826 608 aa25.18■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 CSF1RP07333 972 aa25.18■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 GPSM2P81274 684 aa25.18■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 NIM1KQ8IY84 436 aa25.18■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.17■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.16■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 FAM161AQ3B820 660 aa25.16■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 POTECB2RU33 542 aa25.15■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 C6orf229H3BNL8 230 aa25.15■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 ITGA6P23229 1130 aa25.15■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 FOXO4P98177 505 aa25.15■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.15■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.15■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 POLLQ9UGP5 575 aa25.15■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.14■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CTPS1-206ENST00000470271 LTBP1Q14766 1721 aa25.14■■□□□ 1.61
CTPS1-206ENST00000470271 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CTPS1-206ENST00000470271 WASHC4Q2M389 1173 aa25.13■■□□□ 1.61
CTPS1-206ENST00000470271 GPC2Q8N158 579 aa25.13■■□□□ 1.61
CTPS1-206ENST00000470271 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CTPS1-206ENST00000470271 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.13■■□□□ 1.61
CTPS1-206ENST00000470271 UTYO14607 1347 aa25.12■■□□□ 1.61
CTPS1-206ENST00000470271 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CTPS1-206ENST00000470271 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.12■■□□□ 1.61
CTPS1-206ENST00000470271 EYA3Q99504 573 aa25.12■■□□□ 1.61
CTPS1-206ENST00000470271 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CTPS1-206ENST00000470271 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.12■■□□□ 1.61
CTPS1-206ENST00000470271 SPEF2Q9C093 1822 aa25.12■■□□□ 1.61
CTPS1-206ENST00000470271 KIF16BQ96L93 1317 aa25.12■■□□□ 1.61
CTPS1-206ENST00000470271 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.11■■□□□ 1.61
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