RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 CEP350Q5VT06 3117 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCER2I3L3R5 266 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 COL4A1P02462 1669 aa24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 FSTL1Q12841 308 aa24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 FLIIQ13045 1269 aa24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 G2E3Q7L622 706 aa24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 SP8Q8IXZ3 490 aa24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 LTBP1Q14766 1721 aa24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 FZD9O00144 591 aa24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 JDP2Q8WYK2 163 aa24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 POTECB2RU33 542 aa24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 IGKV5-2P06315 115 aa24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 VPS33BQ9H267 617 aa24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 PDE8AO60658 829 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 MPNDQ8N594 471 aa24.1■■□□□ 1.45
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TRAPPC10-208ENST00000469521 PPIP5K2O43314 1243 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 GPC2Q8N158 579 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 APLP1P51693 650 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 NIM1KQ8IY84 436 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-208ENST00000469521 E9PSI1 815 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-208ENST00000469521 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-208ENST00000469521 AOC3Q16853 763 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPEF2Q9C093 1822 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-208ENST00000469521 CTSWP56202 376 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10-208ENST00000469521 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10-208ENST00000469521 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10-208ENST00000469521 GCKRQ14397 625 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10-208ENST00000469521 LINS1Q8NG48 757 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10-208ENST00000469521 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10-208ENST00000469521 RTL9Q8NET4 1388 aa24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10-208ENST00000469521 H7C1W4 665 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10-208ENST00000469521 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10-208ENST00000469521 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10-208ENST00000469521 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10-208ENST00000469521 HACL1Q9UJ83 578 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC10-208ENST00000469521 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 GPSM2P81274 684 aa24■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLFN5Q08AF3 891 aa24■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 LDHDQ86WU2 507 aa24■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 TTLL11Q8NHH1 800 aa24■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 GJA3Q9Y6H8 435 aa24■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 F6X3S4 739 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 EPHX2P34913 555 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 CASP7P55210 303 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHADLQ6NUI6 762 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 BEND3Q5T5X7 828 aa23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
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TRAPPC10-208ENST00000469521 POTEJP0CG39 1038 aa23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 SCNN1DP51172 638 aa23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 WASHC4Q2M389 1173 aa23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 EYA3Q99504 573 aa23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 GREM2Q9H772 168 aa23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 POLLQ9UGP5 575 aa23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 C6orf229H3BNL8 230 aa23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 CXCL9Q07325 125 aa23.96■■□□□ 1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 PSME4Q14997 1843 aa23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 XDHP47989 1333 aa23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 GGA1Q9UJY5 639 aa23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 A0A1B0GUL6 1792 aa23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 PTPRCP08575 1304 aa23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 YDJCA8MPS7 323 aa23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 ALDH1L1O75891 902 aa23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 UFL1O94874 794 aa23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 TNIP1Q15025 636 aa23.93■■□□□ 1.42
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