RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468358.5

CLDN11-202, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 3

Gene CLDN11, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-202ENST00000468358 SLC51AQ86UW1 340 aa22.04■■□□□ 1.12
CLDN11-202ENST00000468358 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CLDN11-202ENST00000468358 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.04■■□□□ 1.12
CLDN11-202ENST00000468358 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.04■■□□□ 1.12
CLDN11-202ENST00000468358 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.04■■□□□ 1.12
CLDN11-202ENST00000468358 GCKRQ14397 625 aa22.03■■□□□ 1.12
CLDN11-202ENST00000468358 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.03■■□□□ 1.12
CLDN11-202ENST00000468358 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.03■■□□□ 1.12
CLDN11-202ENST00000468358 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CLDN11-202ENST00000468358 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.03■■□□□ 1.12
CLDN11-202ENST00000468358 MYH3P11055 1940 aa22.02■■□□□ 1.12
CLDN11-202ENST00000468358 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CLDN11-202ENST00000468358 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CLDN11-202ENST00000468358 PSMD1Q99460 953 aa22.02■■□□□ 1.12
CLDN11-202ENST00000468358 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.02■■□□□ 1.12
CLDN11-202ENST00000468358 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.01■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 SP8Q8IXZ3 490 aa22.01■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.01■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 TMC4Q7Z404 712 aa22■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 SNED1Q8TER0 1413 aa21.99■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 GLTPD2A6NH11 291 aa21.99■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 H7C1W4 665 aa21.99■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 CTSWP56202 376 aa21.99■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.99■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 BEND3Q5T5X7 828 aa21.99■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 MPNDQ8N594 471 aa21.99■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.99■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.98■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 JDP2Q8WYK2 163 aa21.98■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.98■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.97■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 RRAGCQ9HB90 399 aa21.97■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 PTPRCP08575 1304 aa21.97■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 COL4A1P02462 1669 aa21.97■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 KIF3CO14782 793 aa21.96■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 PPIP5K2O43314 1243 aa21.96■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 C1QTNF8P60827 252 aa21.96■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.96■■□□□ 1.11
CLDN11-202ENST00000468358 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.95■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.95■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 SPEF2Q9C093 1822 aa21.94■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 ALDH1L1O75891 902 aa21.94■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 AOC3Q16853 763 aa21.94■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 GREM2Q9H772 168 aa21.94■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 GRM8O00222 908 aa21.93■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 CASP7P55210 303 aa21.93■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 NIM1KQ8IY84 436 aa21.93■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.93■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.92■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 C6orf229H3BNL8 230 aa21.92■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.92■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 GPSM2P81274 684 aa21.91■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.91■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.9■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 WDR90Q96KV7 1748 aa21.9■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 FAM161AQ3B820 660 aa21.9■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 COL4A5P29400 1685 aa21.9■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 RTL9Q8NET4 1388 aa21.89■■□□□ 1.1
CLDN11-202ENST00000468358 FZD9O00144 591 aa21.89■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 TOMM70O94826 608 aa21.89■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 ITGA6P23229 1130 aa21.89■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 VPS33BQ9H267 617 aa21.89■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.89■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.89■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.88■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 WASHC4Q2M389 1173 aa21.88■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 KIF16BQ96L93 1317 aa21.87■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.87■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 RIMBP2O15034 1052 aa21.87■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 UFL1O94874 794 aa21.87■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 EYA3Q99504 573 aa21.87■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 CSF1RP07333 972 aa21.86■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 FOXO4P98177 505 aa21.86■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.86■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.86■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 POLLQ9UGP5 575 aa21.86■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 GGA1Q9UJY5 639 aa21.86■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 XDHP47989 1333 aa21.85■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 GPC2Q8N158 579 aa21.85■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.85■■□□□ 1.09
CLDN11-202ENST00000468358 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms