RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468031.1

NME4-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-210ENST00000468031 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.61■■□□□ 1.21
NME4-210ENST00000468031 CSF1RP07333 972 aa22.61■■□□□ 1.21
NME4-210ENST00000468031 PIP4K2BP78356 416 aa22.61■■□□□ 1.21
NME4-210ENST00000468031 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
NME4-210ENST00000468031 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.61■■□□□ 1.21
NME4-210ENST00000468031 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.6■■□□□ 1.21
NME4-210ENST00000468031 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
NME4-210ENST00000468031 NLRP10Q86W26 655 aa22.6■■□□□ 1.21
NME4-210ENST00000468031 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NME4-210ENST00000468031 NUP98P52948 1817 aa22.58■■□□□ 1.21
NME4-210ENST00000468031 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
NME4-210ENST00000468031 HLFQ16534 295 aa22.58■■□□□ 1.21
NME4-210ENST00000468031 LRRC24Q50LG9 513 aa22.58■■□□□ 1.21
NME4-210ENST00000468031 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
NME4-210ENST00000468031 SPEF2Q9C093 1822 aa22.58■■□□□ 1.21
NME4-210ENST00000468031 RREB1Q92766 1687 aa22.58■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 FAM89AQ96GI7 184 aa22.58■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.58■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 PALLDQ8WX93 1383 aa22.57■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 VPS53Q5VIR6 699 aa22.56■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.56■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.56■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 PKP1Q13835 747 aa22.56■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 RNF20Q5VTR2 975 aa22.56■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.56■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.56■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.56■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 MYH3P11055 1940 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 AK2P54819 239 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 ARXQ96QS3 562 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.55■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 A0A1B0GUL7 405 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 KCNJ4P48050 445 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 TIMM10P62072 90 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 SLC27A2O14975 620 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 TAF5LO75529 589 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.54■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 BRD1O95696 1058 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 GPTP24298 496 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 PSMA5P28066 241 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 RUFY3Q7L099 469 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.53■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.52■■□□□ 1.2
NME4-210ENST00000468031 CTSWP56202 376 aa22.51■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.51■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.51■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.51■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.51■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 AK7Q96M32 723 aa22.51■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.5■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 SIK1P57059 783 aa22.5■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.5■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.5■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 PDE8AO60658 829 aa22.49■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 ATP6V1AP38606 617 aa22.49■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.49■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.49■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.49■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.49■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 ABCC12Q96J65 1359 aa22.49■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.48■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 FSD2A1L4K1 749 aa22.48■■□□□ 1.19
NME4-210ENST00000468031 GOLIM4O00461 696 aa22.48■■□□□ 1.19
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