RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467480.1

PIM3-202, Transcript of Pim-3 proto-oncogene, serine/threonine kinase, humanhuman

TSL 2

Gene PIM3, Length 723 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIM3-202ENST00000467480 KSR2Q6VAB6 950 aa40.4■■■■■ 4.06
PIM3-202ENST00000467480 CEP350Q5VT06 3117 aa40.39■■■■■ 4.06
PIM3-202ENST00000467480 LAMB2P55268 1798 aa40.39■■■■■ 4.06
PIM3-202ENST00000467480 NIM1KQ8IY84 436 aa40.39■■■■■ 4.06
PIM3-202ENST00000467480 MPNDQ8N594 471 aa40.39■■■■■ 4.06
PIM3-202ENST00000467480 PI4KAP2A4QPH2 592 aa40.38■■■■■ 4.05
PIM3-202ENST00000467480 SLC4A2P04920 1241 aa40.38■■■■■ 4.05
PIM3-202ENST00000467480 GPC2Q8N158 579 aa40.38■■■■■ 4.05
PIM3-202ENST00000467480 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa40.38■■■■■ 4.05
PIM3-202ENST00000467480 VPS33BQ9H267 617 aa40.37■■■■■ 4.05
PIM3-202ENST00000467480 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
PIM3-202ENST00000467480 AOC3Q16853 763 aa40.36■■■■■ 4.05
PIM3-202ENST00000467480 NEXNQ0ZGT2 675 aa40.35■■■■■ 4.05
PIM3-202ENST00000467480 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
PIM3-202ENST00000467480 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
PIM3-202ENST00000467480 HACL1Q9UJ83 578 aa40.35■■■■■ 4.05
PIM3-202ENST00000467480 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
PIM3-202ENST00000467480 MYH16Q9H6N6 1097 aa40.34■■■■■ 4.05
PIM3-202ENST00000467480 GJA3Q9Y6H8 435 aa40.34■■■■■ 4.05
PIM3-202ENST00000467480 CHADLQ6NUI6 762 aa40.33■■■■■ 4.05
PIM3-202ENST00000467480 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
PIM3-202ENST00000467480 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
PIM3-202ENST00000467480 COL4A5P29400 1685 aa40.31■■■■■ 4.04
PIM3-202ENST00000467480 G2E3Q7L622 706 aa40.31■■■■■ 4.04
PIM3-202ENST00000467480 POTEIP0CG38 1075 aa40.3■■■■■ 4.04
PIM3-202ENST00000467480 POTEJP0CG39 1038 aa40.3■■■■■ 4.04
PIM3-202ENST00000467480 HTRA3P83110 453 aa40.3■■■■■ 4.04
PIM3-202ENST00000467480 PDE8AO60658 829 aa40.29■■■■■ 4.04
PIM3-202ENST00000467480 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
PIM3-202ENST00000467480 LDHDQ86WU2 507 aa40.29■■■■■ 4.04
PIM3-202ENST00000467480 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
PIM3-202ENST00000467480 VAMP4O75379 141 aa40.28■■■■■ 4.04
PIM3-202ENST00000467480 EPHX2P34913 555 aa40.28■■■■■ 4.04
PIM3-202ENST00000467480 FLIIQ13045 1269 aa40.28■■■■■ 4.04
PIM3-202ENST00000467480 CCDC152Q4G0S7 254 aa40.28■■■■■ 4.04
PIM3-202ENST00000467480 IGKV5-2P06315 115 aa40.26■■■■■ 4.04
PIM3-202ENST00000467480 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
PIM3-202ENST00000467480 RPS8P62241 208 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
PIM3-202ENST00000467480 KIAA2012Q0VF49 1180 aa40.26■■■■■ 4.04
PIM3-202ENST00000467480 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
PIM3-202ENST00000467480 SCN4AP35499 1836 aa40.26■■■■■ 4.03
PIM3-202ENST00000467480 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
PIM3-202ENST00000467480 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
PIM3-202ENST00000467480 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa40.25■■■■■ 4.03
PIM3-202ENST00000467480 ZNRF3Q9ULT6 936 aa40.25■■■■■ 4.03
PIM3-202ENST00000467480 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
PIM3-202ENST00000467480 CLEC11AQ9Y240 323 aa40.24■■■■■ 4.03
PIM3-202ENST00000467480 CDHR2Q9BYE9 1310 aa40.23■■■■■ 4.03
PIM3-202ENST00000467480 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
PIM3-202ENST00000467480 SEC31BQ9NQW1 1179 aa40.22■■■■■ 4.03
PIM3-202ENST00000467480 NEURL1BA8MQ27 555 aa40.21■■■■■ 4.03
PIM3-202ENST00000467480 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
PIM3-202ENST00000467480 TAF1P21675 1872 aa40.19■■■■■ 4.03
PIM3-202ENST00000467480 C6orf229H3BNL8 230 aa40.18■■■■■ 4.02
PIM3-202ENST00000467480 GPSM2P81274 684 aa40.18■■■■■ 4.02
PIM3-202ENST00000467480 WASHC4Q2M389 1173 aa40.18■■■■■ 4.02
PIM3-202ENST00000467480 DNAAF4Q8WXU2 420 aa40.18■■■■■ 4.02
PIM3-202ENST00000467480 KLRG1Q96E93 195 aa40.18■■■■■ 4.02
PIM3-202ENST00000467480 SCNN1DP51172 638 aa40.17■■■■■ 4.02
PIM3-202ENST00000467480 CTSWP56202 376 aa40.17■■■■■ 4.02
PIM3-202ENST00000467480 LRRC37AA6NMS7 1700 aa40.16■■■■■ 4.02
PIM3-202ENST00000467480 CXCL9Q07325 125 aa40.16■■■■■ 4.02
PIM3-202ENST00000467480 CIAPIN1Q6FI81 312 aa40.15■■■■■ 4.02
PIM3-202ENST00000467480 EYA3Q99504 573 aa40.15■■■■■ 4.02
PIM3-202ENST00000467480 TNIP1Q15025 636 aa40.14■■■■■ 4.02
PIM3-202ENST00000467480 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa40.14■■■■■ 4.02
PIM3-202ENST00000467480 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa40.14■■■■■ 4.02
PIM3-202ENST00000467480 DUOX1Q9NRD9 1551 aa40.14■■■■■ 4.02
PIM3-202ENST00000467480 EPS15P42566 896 aa40.13■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 LINS1Q8NG48 757 aa40.13■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa40.13■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 POLLQ9UGP5 575 aa40.13■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 ZNF521Q96K83 1311 aa40.13■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 COL4A1P02462 1669 aa40.12■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 RAD17O75943 681 aa40.12■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 GCKRQ14397 625 aa40.12■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 H7C1W4 665 aa40.11■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 RIMBP2O15034 1052 aa40.11■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 TTLL11Q8NHH1 800 aa40.1■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 TBC1D16Q8TBP0 767 aa40.1■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 PODXL2Q9NZ53 605 aa40.09■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 GPRC5DQ9NZD1 345 aa40.09■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 BCL2L13Q9BXK5 485 aa40.08■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 CREBZFQ9NS37 354 aa40.08■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 UFL1O94874 794 aa40.07■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 DBNDD1Q9H9R9 158 aa40.07■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 GGA1Q9UJY5 639 aa40.07■■■■■ 4.01
PIM3-202ENST00000467480 YDJCA8MPS7 323 aa40.06■■■■■ 4
PIM3-202ENST00000467480 CNTROBQ8N137 903 aa40.06■■■■■ 4
PIM3-202ENST00000467480 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
PIM3-202ENST00000467480 GREM2Q9H772 168 aa40.06■■■■■ 4
PIM3-202ENST00000467480 PASKQ96RG2 1323 aa40.06■■■■■ 4
PIM3-202ENST00000467480 F6X3S4 739 aa40.05■■■■■ 4
PIM3-202ENST00000467480 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
PIM3-202ENST00000467480 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
PIM3-202ENST00000467480 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms