RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466278.1

MKL1-208, Transcript of MKL/myocardin-like protein 1, human

TSL 3

Gene MKL1, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKL1-208	ENST00000466278	COL4A5	P29400	1685 aa		29.28	■■■□□ 2.28
MKL1-208	ENST00000466278	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		29.27	■■■□□ 2.28
MKL1-208	ENST00000466278	KSR2	Q6VAB6	950 aa		29.27	■■■□□ 2.28
MKL1-208	ENST00000466278	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		29.27	■■■□□ 2.28
MKL1-208	ENST00000466278	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
MKL1-208	ENST00000466278	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		29.26	■■■□□ 2.27
MKL1-208	ENST00000466278	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		29.25	■■■□□ 2.27
MKL1-208	ENST00000466278	SLC4A2	P04920	1241 aa		29.25	■■■□□ 2.27
MKL1-208	ENST00000466278	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
MKL1-208	ENST00000466278	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		29.25	■■■□□ 2.27
MKL1-208	ENST00000466278	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
MKL1-208	ENST00000466278	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
MKL1-208	ENST00000466278	VPS33B	Q9H267	617 aa		29.24	■■■□□ 2.27
MKL1-208	ENST00000466278	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		29.24	■■■□□ 2.27
MKL1-208	ENST00000466278	PPIP5K2	O43314	1243 aa		29.23	■■■□□ 2.27
MKL1-208	ENST00000466278	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
MKL1-208	ENST00000466278	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		29.23	■■■□□ 2.27
MKL1-208	ENST00000466278	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
MKL1-208	ENST00000466278	G2E3	Q7L622	706 aa		29.22	■■■□□ 2.27
MKL1-208	ENST00000466278	NIM1K	Q8IY84	436 aa		29.22	■■■□□ 2.27
MKL1-208	ENST00000466278	GPC2	Q8N158	579 aa		29.22	■■■□□ 2.27
MKL1-208	ENST00000466278	MPND	Q8N594	471 aa		29.22	■■■□□ 2.27
MKL1-208	ENST00000466278	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	29.21	■■■□□ 2.27
MKL1-208	ENST00000466278	VAMP4	O75379	141 aa		29.2	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	FLII	Q13045	1269 aa		29.2	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	AOC3	Q16853	763 aa		29.2	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	PDE8A	O60658	829 aa		29.19	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	IGKV5-2	P06315	115 aa		29.19	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	HACL1	Q9UJ83	578 aa		29.19	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		29.19	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		29.18	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	COL4A1	P02462	1669 aa		29.18	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		29.17	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	MYH3	P11055	1940 aa		29.17	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	ZNF521	Q96K83	1311 aa		29.17	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	CHADL	Q6NUI6	762 aa		29.16	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		29.16	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		29.15	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		29.15	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	LDHD	Q86WU2	507 aa		29.15	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	POTEI	P0CG38	1075 aa		29.14	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	POTEJ	P0CG39	1038 aa		29.14	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	EPHX2	P34913	555 aa		29.14	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
MKL1-208	ENST00000466278	LTBP1	Q14766	1721 aa		29.14	■■■□□ 2.25
MKL1-208	ENST00000466278	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		29.13	■■■□□ 2.25
MKL1-208	ENST00000466278	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		29.13	■■■□□ 2.25
MKL1-208	ENST00000466278	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		29.12	■■■□□ 2.25
MKL1-208	ENST00000466278	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		29.12	■■■□□ 2.25
MKL1-208	ENST00000466278	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
MKL1-208	ENST00000466278	CTSW	P56202	376 aa		29.11	■■■□□ 2.25
MKL1-208	ENST00000466278	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
MKL1-208	ENST00000466278	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
MKL1-208	ENST00000466278	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
MKL1-208	ENST00000466278	HTRA3	P83110	453 aa		29.1	■■■□□ 2.25
MKL1-208	ENST00000466278	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		29.1	■■■□□ 2.25
MKL1-208	ENST00000466278	GPSM2	P81274	684 aa		29.09	■■■□□ 2.25
MKL1-208	ENST00000466278	LINS1	Q8NG48	757 aa		29.09	■■■□□ 2.25
MKL1-208	ENST00000466278	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
MKL1-208	ENST00000466278	SCNN1D	P51172	638 aa		29.08	■■■□□ 2.25
MKL1-208	ENST00000466278	GCKR	Q14397	625 aa		29.08	■■■□□ 2.25
MKL1-208	ENST00000466278	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		29.08	■■■□□ 2.25
MKL1-208	ENST00000466278		H7C1W4	665 aa		29.07	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	CCER2	I3L3R5	266 aa		29.07	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	CXCL9	Q07325	125 aa		29.07	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	WASHC4	Q2M389	1173 aa		29.07	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	RTL9	Q8NET4	1388 aa		29.06	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	C6orf229	H3BNL8	230 aa		29.06	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		29.06	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		29.06	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	EYA3	Q99504	573 aa		29.06	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		29.05	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	KLRG1	Q96E93	195 aa		29.05	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		29.05	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	POLL	Q9UGP5	575 aa		29.05	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		29.05	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278		E9PSI1	815 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	SPEF2	Q9C093	1822 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	TNIP1	Q15025	636 aa		29.03	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		29.03	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		29.03	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	YDJC	A8MPS7	323 aa		29.02	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	RAD17	O75943	681 aa		29.02	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	EPS15	P42566	896 aa		29.02	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	GREM2	Q9H772	168 aa		29.02	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		29.02	■■■□□ 2.24
MKL1-208	ENST00000466278		F6X3S4	739 aa		29.01	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	UFL1	O94874	794 aa		29.01	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	CASP7	P55210	303 aa		29.01	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	GGA1	Q9UJY5	639 aa		29.01	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	PASK	Q96RG2	1323 aa		29	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	RIMBP2	O15034	1052 aa		29	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23

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