RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466252.5

SNX21-208, Transcript of sorting nexin family member 21, human

TSL 3

Gene SNX21, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX21-208	ENST00000466252	CSF1R	P07333	972 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SNX21-208	ENST00000466252	USP44	Q9H0E7	712 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SNX21-208	ENST00000466252	SBF1	O95248	1867 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SNX21-208	ENST00000466252	NFKBIE	O00221	500 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SNX21-208	ENST00000466252	PRELP	P51888	382 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SNX21-208	ENST00000466252	FOXO4	P98177	505 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SNX21-208	ENST00000466252	GRAP	Q13588	217 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SNX21-208	ENST00000466252	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
SNX21-208	ENST00000466252	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
SNX21-208	ENST00000466252	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	CTSW	P56202	376 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	SOGA3	Q5TF21	947 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	TNN	Q9UQP3	1299 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	MYH3	P11055	1940 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	TRIM27	P14373	513 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	SLC51A	Q86UW1	340 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	SP8	Q8IXZ3	490 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	KAZALD1	Q96I82	304 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	SNED1	Q8TER0	1413 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	COL4A1	P02462	1669 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	CCDC93	Q567U6	631 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	RASSF7	Q02833	373 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	GREM2	Q9H772	168 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	RTL9	Q8NET4	1388 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SNX21-208	ENST00000466252	SUCLG2	Q96I99	432 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SNX21-208	ENST00000466252	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SNX21-208	ENST00000466252	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SNX21-208	ENST00000466252	TMC4	Q7Z404	712 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SNX21-208	ENST00000466252	YY1	P25490	414 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SNX21-208	ENST00000466252	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SNX21-208	ENST00000466252	LMNB1	P20700	586 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SNX21-208	ENST00000466252	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	29.04	■■■□□ 2.24
SNX21-208	ENST00000466252	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SNX21-208	ENST00000466252	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SNX21-208	ENST00000466252	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SNX21-208	ENST00000466252	PSMD1	Q99460	953 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SNX21-208	ENST00000466252	ITGA6	P23229	1130 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	FAM161A	Q3B820	660 aa		29	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		29	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		29	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	RNF181	Q9P0P0	153 aa		29	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	RLBP1	P12271	317 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	MPND	Q8N594	471 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	MEIS3	Q99687	375 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	GPSM2	P81274	684 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
SNX21-208	ENST00000466252	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		28.95	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		28.95	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	VPS33B	Q9H267	617 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	PLIN1	O60240	522 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	GNAI3	P08754	354 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	POLL	Q9UGP5	575 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	PANK1	Q8TE04	598 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	LTBP1	Q14766	1721 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SNX21-208	ENST00000466252	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		28.89	■■■□□ 2.22

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