RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		22.51	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	LMNB1	P20700	586 aa		22.5	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	22.5	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		22.5	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		22.5	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902		H7C1W4	665 aa		22.49	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	BBOX1	O75936	387 aa		22.49	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	GRAP	Q13588	217 aa		22.49	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		22.49	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		22.49	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	22.49	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	22.49	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	PRELP	P51888	382 aa		22.48	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	22.48	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		22.47	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		22.47	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	22.47	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	ALDH1L1	O75891	902 aa		22.46	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	CTSW	P56202	376 aa		22.46	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		22.46	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	22.46	■■□□□ 1.19
USP19-210	ENST00000465902	GRM8	O00222	908 aa		22.45	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	22.45	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	SLC51A	Q86UW1	340 aa		22.45	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	22.45	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		22.45	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		22.45	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	TOMM70	O94826	608 aa		22.44	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		22.44	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	22.44	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	KIF16B	Q96L93	1317 aa		22.44	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	22.44	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	BCAR3	O75815	825 aa		22.43	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	CASP7	P55210	303 aa		22.43	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	22.43	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		22.43	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	SP8	Q8IXZ3	490 aa		22.43	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		22.43	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	22.43	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		22.43	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	HSPA6	P17066	643 aa		22.42	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	22.42	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	TMC4	Q7Z404	712 aa		22.42	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	SPEF2	Q9C093	1822 aa		22.42	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	22.41	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	22.41	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	GREM2	Q9H772	168 aa		22.41	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		22.41	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		22.4	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	MPND	Q8N594	471 aa		22.4	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	22.4	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	22.4	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	PSMD1	Q99460	953 aa		22.4	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		22.4	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	COL4A1	P02462	1669 aa		22.39	■■□□□ 1.18
USP19-210	ENST00000465902	CEP350	Q5VT06	3117 aa		22.39	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	GLTPD2	A6NH11	291 aa		22.39	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	22.39	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	22.38	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	RRAGC	Q9HB90	399 aa		22.38	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	22.38	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	22.37	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	FOXO4	P98177	505 aa		22.37	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	FAM161A	Q3B820	660 aa		22.37	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		22.37	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	22.37	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		22.37	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	CSF1R	P07333	972 aa		22.36	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	ITGA6	P23229	1130 aa		22.36	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		22.36	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	22.36	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		22.36	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	SNED1	Q8TER0	1413 aa		22.36	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		22.36	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	PPIP5K2	O43314	1243 aa		22.35	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	22.35	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		22.35	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	JDP2	Q8WYK2	163 aa		22.35	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	SUCLG2	Q96I99	432 aa		22.35	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		22.35	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	RTL9	Q8NET4	1388 aa		22.35	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		22.34	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	C6orf229	H3BNL8	230 aa		22.34	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	GPSM2	P81274	684 aa		22.34	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	22.34	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		22.34	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		22.34	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		22.34	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		22.34	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	USP44	Q9H0E7	712 aa		22.34	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	AOC3	Q16853	763 aa		22.33	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		22.33	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		22.33	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		22.33	■■□□□ 1.17
USP19-210	ENST00000465902	UTY	O14607	1347 aa		22.32	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	TRIM27	P14373	513 aa		22.32	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	22.32	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	22.32	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	TNN	Q9UQP3	1299 aa		22.32	■■□□□ 1.16
USP19-210	ENST00000465902	FSTL1	Q12841	308 aa		22.31	■■□□□ 1.16

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