RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.06■■□□□ 1.76
SCAF8-204ENST00000461219 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
SCAF8-204ENST00000461219 F6X3S4 739 aa26.05■■□□□ 1.76
SCAF8-204ENST00000461219 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.05■■□□□ 1.76
SCAF8-204ENST00000461219 TMC4Q7Z404 712 aa26.05■■□□□ 1.76
SCAF8-204ENST00000461219 LINS1Q8NG48 757 aa26.05■■□□□ 1.76
SCAF8-204ENST00000461219 PSMD1Q99460 953 aa26.05■■□□□ 1.76
SCAF8-204ENST00000461219 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.05■■□□□ 1.76
SCAF8-204ENST00000461219 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
SCAF8-204ENST00000461219 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.04■■□□□ 1.76
SCAF8-204ENST00000461219 JDP2Q8WYK2 163 aa26.04■■□□□ 1.76
SCAF8-204ENST00000461219 SPEF2Q9C093 1822 aa26.03■■□□□ 1.76
SCAF8-204ENST00000461219 GCKRQ14397 625 aa26.03■■□□□ 1.76
SCAF8-204ENST00000461219 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
SCAF8-204ENST00000461219 SP8Q8IXZ3 490 aa26.03■■□□□ 1.76
SCAF8-204ENST00000461219 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.03■■□□□ 1.76
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
SCAF8-204ENST00000461219 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.03■■□□□ 1.76
SCAF8-204ENST00000461219 GLTPD2A6NH11 291 aa26.02■■□□□ 1.76
SCAF8-204ENST00000461219 C1QTNF8P60827 252 aa26.01■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 MPNDQ8N594 471 aa26.01■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.01■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.01■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 RRAGCQ9HB90 399 aa26■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 CTSWP56202 376 aa25.99■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.99■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.99■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 PTPRCP08575 1304 aa25.98■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 PPIP5K2O43314 1243 aa25.98■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.98■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 H7C1W4 665 aa25.97■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 KIF3CO14782 793 aa25.97■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.97■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 NIM1KQ8IY84 436 aa25.97■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.97■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.97■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 BEND3Q5T5X7 828 aa25.96■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 SLC51AQ86UW1 340 aa25.96■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SCAF8-204ENST00000461219 SNED1Q8TER0 1413 aa25.95■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 WDR90Q96KV7 1748 aa25.94■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 ALDH1L1O75891 902 aa25.94■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 AOC3Q16853 763 aa25.94■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.94■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 C6orf229H3BNL8 230 aa25.93■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.93■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 VPS33BQ9H267 617 aa25.93■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.93■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 TOMM70O94826 608 aa25.92■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 GREM2Q9H772 168 aa25.92■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 SCN4AP35499 1836 aa25.91■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 GRM8O00222 908 aa25.91■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 COL4A1P02462 1669 aa25.9■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 EYA3Q99504 573 aa25.9■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.9■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.9■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.89■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 FZD9O00144 591 aa25.89■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 GPSM2P81274 684 aa25.89■■□□□ 1.74
SCAF8-204ENST00000461219 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.88■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 G3V3G9 751 aa25.88■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 CASP7P55210 303 aa25.88■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 WASHC4Q2M389 1173 aa25.88■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.88■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.88■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 RTL9Q8NET4 1388 aa25.87■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 ITGA6P23229 1130 aa25.87■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 FAM161AQ3B820 660 aa25.87■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 GGA1Q9UJY5 639 aa25.87■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.86■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 RIMBP2O15034 1052 aa25.86■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 UFL1O94874 794 aa25.86■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.86■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.86■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 GPC2Q8N158 579 aa25.86■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 COL4A5P29400 1685 aa25.85■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.85■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.85■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.85■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 KIF16BQ96L93 1317 aa25.85■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
SCAF8-204ENST00000461219 LTBP1Q14766 1721 aa25.84■■□□□ 1.73
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