RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	DISP2	A7MBM2	1401 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	AK7	Q96M32	723 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	KIF3A	Q9Y496	699 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF609	O15014	1411 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	EYA2	O00167	538 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	AK2	P54819	239 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	RREB1	Q92766	1687 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	NBPF26	B4DH59	902 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	FOXO4	P98177	505 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	TFCP2	Q12800	502 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	NBPF14	Q5TI25	921 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	NBPF15	Q8N660	670 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	BCL9	O00512	1426 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	EXOC5	O00471	708 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21	8e-6	■■■□□ 17.3
TTLL3-222	ENST00000459758	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC27A2	O14975	620 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	STX6	O43752	255 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	BTG4	Q9NY30	223 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	CHD4	Q14839	1912 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	A1BG	P04217	495 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	PTH1R	Q03431	593 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	TAF5L	O75529	589 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22	7e-17	■■■□□ 14.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A0D9SFI3	127 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM227B	Q96M60	508 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	IL25	Q9H293	177 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	RGL2	O15211	777 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	F13A1	P00488	732 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	CSF1R	P07333	972 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	UBE2H	P62256	183 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	HS1BP3	Q53T59	392 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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