RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452514.6

MEG3-211, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MEG3, Length 461 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-211ENST00000452514 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.5■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.49■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 USP44Q9H0E7 712 aa22.49■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 TAF1P21675 1872 aa22.49■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 C21orf2O43822 256 aa22.48■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 GRAPQ13588 217 aa22.48■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.48■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.48■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 FOXO4P98177 505 aa22.47■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.47■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 SUCLG2Q96I99 432 aa22.47■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 RTL9Q8NET4 1388 aa22.47■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 SLC51AQ86UW1 340 aa22.46■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 KAZALD1Q96I82 304 aa22.46■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.46■■□□□ 1.19
MEG3-211ENST00000452514 CSF1RP07333 972 aa22.45■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 RLBP1P12271 317 aa22.45■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 OLFM4Q6UX06 510 aa22.45■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.45■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.45■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 GREM2Q9H772 168 aa22.45■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 SNED1Q8TER0 1413 aa22.45■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.45■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.44■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 SOGA3Q5TF21 947 aa22.44■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 BBOX1O75936 387 aa22.43■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 FAM161AQ3B820 660 aa22.43■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 MEIS3Q99687 375 aa22.43■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 NFKBIEO00221 500 aa22.42■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 PLIN1O60240 522 aa22.42■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 CCDC93Q567U6 631 aa22.42■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.42■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 RASSF7Q02833 373 aa22.41■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.41■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.41■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 TMC4Q7Z404 712 aa22.41■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.41■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 PANK1Q8TE04 598 aa22.41■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 CHD4Q14839 1912 aa22.41■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 ITGA6P23229 1130 aa22.4■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 SP8Q8IXZ3 490 aa22.4■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.39■■□□□ 1.18
MEG3-211ENST00000452514 SPEF2Q9C093 1822 aa22.39■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 GNAI3P08754 354 aa22.38■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 MS4A1P11836 297 aa22.38■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.38■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.38■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.38■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 SBF1O95248 1867 aa22.37■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 PRELPP51888 382 aa22.37■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.37■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.37■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.36■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.36■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 LTBP1Q14766 1721 aa22.36■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.35■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.35■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 PSMD1Q99460 953 aa22.35■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.34■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 LMNB1P20700 586 aa22.33■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 PDE3AQ14432 1141 aa22.33■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.33■■□□□ 1.17
MEG3-211ENST00000452514 UTRNP46939 3433 aa22.32■■□□□ 1.16
MEG3-211ENST00000452514 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
MEG3-211ENST00000452514 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
MEG3-211ENST00000452514 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.32■■□□□ 1.16
MEG3-211ENST00000452514 MPNDQ8N594 471 aa22.32■■□□□ 1.16
MEG3-211ENST00000452514 COG6Q9Y2V7 657 aa22.32■■□□□ 1.16
MEG3-211ENST00000452514 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.32■■□□□ 1.16
MEG3-211ENST00000452514 GNAI2P04899 355 aa22.31■■□□□ 1.16
MEG3-211ENST00000452514 GPSM2P81274 684 aa22.31■■□□□ 1.16
MEG3-211ENST00000452514 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
MEG3-211ENST00000452514 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
MEG3-211ENST00000452514 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
MEG3-211ENST00000452514 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
MEG3-211ENST00000452514 RNF181Q9P0P0 153 aa22.31■■□□□ 1.16
MEG3-211ENST00000452514 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms