RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446182.5

PTPRN-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, human

TSL 5

Gene PTPRN, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRN-208	ENST00000446182	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	MPND	Q8N594	471 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	CHL1	O00533	1208 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	LAMB2	P55268	1798 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	RAD17	O75943	681 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	FAM161A	Q3B820	660 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-208	ENST00000446182	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	YDJC	A8MPS7	323 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	GRM1	Q13255	1194 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	TNIP1	Q15025	636 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	NEUROD2	Q15784	382 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	TMC4	Q7Z404	712 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	SHTN1	A0MZ66	631 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	ABHD8	Q96I13	439 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	AOC2	O75106	756 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	HOXB7	P09629	217 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	MAP2K2	P36507	400 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	RUNDC1	Q96C34	613 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	FAM89A	Q96GI7	184 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	MICALL2	Q8IY33	904 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	TSKS	Q9UJT2	592 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	COL4A1	P02462	1669 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	TAF1	P21675	1872 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182		H7C1D1	291 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	PSMD14	O00487	310 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	GPSM2	P81274	684 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	13.65	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	WASHC4	Q2M389	1173 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	DPF2	Q92785	391 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	HYPK	Q9NX55	129 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	POLL	Q9UGP5	575 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PTPRN-208	ENST00000446182	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	USP48	Q86UV5	1035 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	CFAP44	Q96MT7	982 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	RTL9	Q8NET4	1388 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	C6orf229	H3BNL8	230 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	RIMBP2	O15034	1052 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	CA12	O43570	354 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	EGFR	P00533	1210 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	DLK2	Q6UY11	383 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	MBIP	Q9NS73	344 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	ECE2	O60344	883 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	DOK7	Q18PE1	504 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	EYA3	Q99504	573 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRN-208	ENST00000446182	HUNK	P57058	714 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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