RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445020.1

KNOP1P4-201, Transcript of lysine rich nucleolar protein 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene KNOP1P4, Length 1,438 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1P4-201ENST00000445020 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
KNOP1P4-201ENST00000445020 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.79□□□□□ -0.04
KNOP1P4-201ENST00000445020 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.79□□□□□ -0.04
KNOP1P4-201ENST00000445020 SYT17Q9BSW7 474 aa14.79□□□□□ -0.04
KNOP1P4-201ENST00000445020 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
KNOP1P4-201ENST00000445020 CSF1RP07333 972 aa14.78□□□□□ -0.04
KNOP1P4-201ENST00000445020 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
KNOP1P4-201ENST00000445020 ALDH1B1P30837 517 aa14.78□□□□□ -0.04
KNOP1P4-201ENST00000445020 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.78□□□□□ -0.04
KNOP1P4-201ENST00000445020 SYNE4Q8N205 404 aa14.78□□□□□ -0.04
KNOP1P4-201ENST00000445020 MEIS3Q99687 375 aa14.78□□□□□ -0.04
KNOP1P4-201ENST00000445020 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
KNOP1P4-201ENST00000445020 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
KNOP1P4-201ENST00000445020 TMC4Q7Z404 712 aa14.77□□□□□ -0.04
KNOP1P4-201ENST00000445020 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.77□□□□□ -0.04
KNOP1P4-201ENST00000445020 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
KNOP1P4-201ENST00000445020 CNKSR1Q969H4 720 aa14.77□□□□□ -0.04
KNOP1P4-201ENST00000445020 COG6Q9Y2V7 657 aa14.77□□□□□ -0.04
KNOP1P4-201ENST00000445020 LTBP1Q14766 1721 aa14.77□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 GNAI2P04899 355 aa14.76□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 FOXO4P98177 505 aa14.76□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 MTX1Q13505 466 aa14.76□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.76□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 KAZALD1Q96I82 304 aa14.76□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 SUCLG2Q96I99 432 aa14.76□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 PIM2Q9P1W9 311 aa14.76□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 DPEP1P16444 411 aa14.75□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 C20orf194Q5TEA3 1177 aa14.75□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 KLHL34Q8N239 644 aa14.75□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 KCNA3P22001 575 aa14.75□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.75□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.74□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 BBOX1O75936 387 aa14.74□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 CHRNA5P30532 468 aa14.74□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 GRAPQ13588 217 aa14.74□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.74□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.74□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.74□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 TTLL6Q8N841 843 aa14.74□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.74□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.73□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 SOGA3Q5TF21 947 aa14.73□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.73□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.73□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 FBXO3Q9UK99 471 aa14.73□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 COL4A1P02462 1669 aa14.72□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 A0A0G2JLW4 131 aa14.72□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.72□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.72□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 FAM161AQ3B820 660 aa14.72□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 GREM2Q9H772 168 aa14.72□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 PSME4Q14997 1843 aa14.71□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.71□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 ITGA6P23229 1130 aa14.71□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
KNOP1P4-201ENST00000445020 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.7□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 CRBNQ96SW2 442 aa14.69□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.69□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 SNED1Q8TER0 1413 aa14.69□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 HMMRO75330 724 aa14.68□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 ATP8B2P98198 1209 aa14.68□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 SP8Q8IXZ3 490 aa14.68□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 SSH3Q8TE77 659 aa14.68□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 COPRSQ9NQ92 184 aa14.68□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.68□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.68□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.68□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 SRGAP3O43295 1099 aa14.67□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.67□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 CEP85Q6P2H3 762 aa14.67□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.67□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.67□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.67□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 CIAO1O76071 339 aa14.66□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 POLA2Q14181 598 aa14.66□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 CCDC93Q567U6 631 aa14.66□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 BCS1LQ9Y276 419 aa14.66□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.66□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 GRIN3BO60391 1043 aa14.66□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms