RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443667.1

PDZK1-204, Transcript of PDZ domain containing 1, human

TSL 5

Gene PDZK1, Length 1,010 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDZK1-204	ENST00000443667	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	CLCN6	P51797	869 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	CCDC102A	Q96A19	550 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	PANK3	Q9H999	370 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	ADM5	C9JUS6	153 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	SLC10A3	P09131	477 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	NUBP1	P53384	320 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	TBC1D8	O95759	1140 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	EGFR	P00533	1210 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
PDZK1-204	ENST00000443667	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	NUP98	P52948	1817 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	BTBD11	A6QL63	1104 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	MICALL2	Q8IY33	904 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667		H7C1D1	291 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	DLL1	O00548	723 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	GPT	P24298	496 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	NGEF	Q8N5V2	710 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	POTEF	A5A3E0	1075 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	YDJC	A8MPS7	323 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	TNIP1	Q15025	636 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	NYX	Q9GZU5	481 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		11.85	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	SUSD4	Q5VX71	490 aa		11.85	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		11.85	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	VPS33B	Q9H267	617 aa		11.85	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	HTT	P42858	3142 aa		11.84	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		11.84	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	CDCA5	Q96FF9	252 aa		11.84	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	SZT2	Q5T011	3432 aa		11.84	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	ABCC4	O15439	1325 aa		11.84	□□□□□ -0.51
PDZK1-204	ENST00000443667	TAF1	P21675	1872 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	LAMB2	P55268	1798 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	GPR25	O00155	361 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	PSMD14	O00487	310 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	RGL2	O15211	777 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	MOB2	Q70IA6	237 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	MPND	Q8N594	471 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	GGA3	Q9NZ52	723 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	NTSR2	O95665	410 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	CENPF	P49454	3210 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	SULF1	Q8IWU6	871 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	KIF12	Q96FN5	646 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	MCM10	Q7L590	875 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PDZK1-204	ENST00000443667	DPF2	Q92785	391 aa		11.8	□□□□□ -0.52

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms