RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428316.1

RPSAP46-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 46, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP46, Length 882 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP46-201ENST00000428316 NEURL1BA8MQ27 555 aa15.57■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 H7C1W4 665 aa15.57■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 ZNF541Q9H0D2 1346 aa15.57■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 COL4A1P02462 1669 aa15.57■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 HSPA6P17066 643 aa15.56■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 SLFN5Q08AF3 891 aa15.56■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 VPS33BQ9H267 617 aa15.56■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 SEC31BQ9NQW1 1179 aa15.56■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 CDHR2Q9BYE9 1310 aa15.56■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 TIAM2Q8IVF5 1701 aa15.55■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 WDR90Q96KV7 1748 aa15.55■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 PDE8AO60658 829 aa15.55■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 CASP7P55210 303 aa15.55■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 CDCA7LQ96GN5 454 aa15.55■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 CEP350Q5VT06 3117 aa15.54■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 RPS8P62241 208 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 GCKRQ14397 625 aa15.54■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 TMC4Q7Z404 712 aa15.54■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 MPNDQ8N594 471 aa15.54■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 DNAAF4Q8WXU2 420 aa15.54■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 TAF1P21675 1872 aa15.54■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 NEXNQ0ZGT2 675 aa15.53■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 FSTL1Q12841 308 aa15.53■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 LINS1Q8NG48 757 aa15.53■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 TTLL11Q8NHH1 800 aa15.53■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 E9PSI1 815 aa15.52■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 F6X3S4 739 aa15.52■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 AOC3Q16853 763 aa15.52■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 BEND3Q5T5X7 828 aa15.52■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 MIER1Q8N108 512 aa15.52■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 LARGE2Q8N3Y3 721 aa15.52■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 JDP2Q8WYK2 163 aa15.52■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 POLLQ9UGP5 575 aa15.52■□□□□ 0.08
RPSAP46-201ENST00000428316 PPIP5K2O43314 1243 aa15.51■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 POTEIP0CG38 1075 aa15.51■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 POTEJP0CG39 1038 aa15.51■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 GPSM2P81274 684 aa15.51■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 KIAA2012Q0VF49 1180 aa15.51■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 GPC2Q8N158 579 aa15.51■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 SUPT20HQ8NEM7 779 aa15.51■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 PLA2G12BQ9BX93 195 aa15.51■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 CTSWP56202 376 aa15.5■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 CCDC152Q4G0S7 254 aa15.5■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 SMC1BQ8NDV3 1235 aa15.5■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 YDJCA8MPS7 323 aa15.49■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 CSF1RP07333 972 aa15.49■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 CXCL9Q07325 125 aa15.49■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa15.49■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa15.49■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 GREM2Q9H772 168 aa15.49■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 PODXL2Q9NZ53 605 aa15.49■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 ZNRF3Q9ULT6 936 aa15.49■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 DUOX1Q9NRD9 1551 aa15.49■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 IQCA1LA6NCM1 817 aa15.48■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 EIF6P56537 245 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 NIM1KQ8IY84 436 aa15.48■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 TBC1D16Q8TBP0 767 aa15.48■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 LRRC37AA6NMS7 1700 aa15.47■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 SCNN1DP51172 638 aa15.47■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 APLP1P51693 650 aa15.47■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 FOXO4P98177 505 aa15.47■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 SSH1Q8WYL5 1049 aa15.47■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 CACNA1FO60840 1977 aa15.47■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 RTL9Q8NET4 1388 aa15.47■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 EPS15P42566 896 aa15.46■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 HTRA3P83110 453 aa15.46■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 WASHC4Q2M389 1173 aa15.46■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 CHADLQ6NUI6 762 aa15.46■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 HACL1Q9UJ83 578 aa15.46■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 GJA3Q9Y6H8 435 aa15.46■□□□□ 0.07
RPSAP46-201ENST00000428316 EPHX2P34913 555 aa15.45■□□□□ 0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa15.45■□□□□ 0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 MINPP1Q9UNW1 487 aa15.45■□□□□ 0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 LTBP1Q14766 1721 aa15.45■□□□□ 0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 C6orf229H3BNL8 230 aa15.44■□□□□ 0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 RIMBP2O15034 1052 aa15.44■□□□□ 0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 EPHA10Q5JZY3 1008 aa15.44■□□□□ 0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 LDHDQ86WU2 507 aa15.44■□□□□ 0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 KCNQ5Q9NR82 932 aa15.44■□□□□ 0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 SCN4AP35499 1836 aa15.43■□□□□ 0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 ALDH1L1O75891 902 aa15.43■□□□□ 0.06
RPSAP46-201ENST00000428316 RAD17O75943 681 aa15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms