RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422049.1

C6orf47-AS1-203, C6orf47 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C6orf47-AS1, Length 673 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
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C6orf47-AS1-203ENST00000422049 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.61■□□□□ 0.89
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.61■□□□□ 0.89
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 CNKSR1Q969H4 720 aa20.61■□□□□ 0.89
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 PIM2Q9P1W9 311 aa20.61■□□□□ 0.89
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C6orf47-AS1-203ENST00000422049 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
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C6orf47-AS1-203ENST00000422049 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
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C6orf47-AS1-203ENST00000422049 GREM2Q9H772 168 aa20.54■□□□□ 0.88
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.53■□□□□ 0.88
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 ITGA6P23229 1130 aa20.53■□□□□ 0.88
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.52■□□□□ 0.88
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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C6orf47-AS1-203ENST00000422049 SLX4Q8IY92 1834 aa20.52■□□□□ 0.88
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C6orf47-AS1-203ENST00000422049 ATP8B2P98198 1209 aa20.5■□□□□ 0.87
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.5■□□□□ 0.87
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C6orf47-AS1-203ENST00000422049 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.5■□□□□ 0.87
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C6orf47-AS1-203ENST00000422049 POLA2Q14181 598 aa20.48■□□□□ 0.87
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 COPRSQ9NQ92 184 aa20.48■□□□□ 0.87
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.47■□□□□ 0.87
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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C6orf47-AS1-203ENST00000422049 CRBNQ96SW2 442 aa20.47■□□□□ 0.87
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 TAF1P21675 1872 aa20.47■□□□□ 0.87
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.46■□□□□ 0.87
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 BCS1LQ9Y276 419 aa20.46■□□□□ 0.87
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 SRGAP3O43295 1099 aa20.45■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 CIAO1O76071 339 aa20.45■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.45■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.45■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.45■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.45■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 COL4A1P02462 1669 aa20.45■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 CCDC93Q567U6 631 aa20.44■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.44■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.43■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.43■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 PSMD1Q99460 953 aa20.43■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 VPS33BQ9H267 617 aa20.43■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.43■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.43■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 CACNA1SQ13698 1873 aa20.42■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 EYA2O00167 538 aa20.42■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 C21orf2O43822 256 aa20.42■□□□□ 0.86
C6orf47-AS1-203ENST00000422049 HMMRO75330 724 aa20.42■□□□□ 0.86
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