RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 LINS1Q8NG48 757 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNB2Q92953 911 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 PLCB2Q00722 1185 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP4K1Q92918 833 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0D9SFI3 127 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 COPS6Q7L5N1 327 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 FSD1Q9BTV5 496 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC27A2O14975 620 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 FERMT3Q86UX7 667 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 HIP1O00291 1037 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 KDM4AO75164 1064 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMA5P28066 241 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV5-2P06315 115 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 A1BGP04217 495 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 UTYO14607 1347 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC6Q86TZ1 520 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 MYD88Q99836 296 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 STK3Q13188 491 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF20Q5VTR2 975 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 EP400Q96L91 3159 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT85P78386 507 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 AP5Z1O43299 807 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 DYNC1I1O14576 645 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS6KB1P23443 525 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCC6O95255 1503 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 NBPF26B4DH59 902 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 CAMK4Q16566 473 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 NBPF14Q5TI25 921 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 NBPF15Q8N660 670 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 SNRKQ9NRH2 765 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC192P0DO97 292 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 LIG1P18858 919 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 MED23Q9ULK4 1368 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 PDCP20941 246 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD1Q15327 319 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 GCKRQ14397 625 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 PHLPP1O60346 1717 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 SPC24Q8NBT2 197 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 PIGBQ92521 554 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 MRC1P22897 1456 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 TAF5LO75529 589 aa22.13■■□□□ 1.13
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