RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417464.6

UPP1-205, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 782 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-205ENST00000417464 PSMD1Q99460 953 aa24.74■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.74■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 SLFN5Q08AF3 891 aa24.73■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.73■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.73■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 POTECB2RU33 542 aa24.72■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 E9PSI1 815 aa24.72■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 BBOX1O75936 387 aa24.71■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.71■■□□□ 1.55
UPP1-205ENST00000417464 AOC3Q16853 763 aa24.7■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.7■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 SP8Q8IXZ3 490 aa24.7■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 PDE8AO60658 829 aa24.69■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.69■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.69■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.68■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 TOMM70O94826 608 aa24.68■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 GCKRQ14397 625 aa24.68■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.68■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.67■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 PPIP5K2O43314 1243 aa24.67■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 CTSWP56202 376 aa24.67■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 MPNDQ8N594 471 aa24.67■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 GPSM2P81274 684 aa24.66■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 LINS1Q8NG48 757 aa24.66■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.66■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 WDR90Q96KV7 1748 aa24.66■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 H7C1W4 665 aa24.65■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 FZD9O00144 591 aa24.65■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 CASP7P55210 303 aa24.65■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.65■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 BEND3Q5T5X7 828 aa24.65■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.65■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.64■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 JDP2Q8WYK2 163 aa24.64■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 GREM2Q9H772 168 aa24.64■■□□□ 1.54
UPP1-205ENST00000417464 POTEIP0CG38 1075 aa24.63■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 POTEJP0CG39 1038 aa24.63■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.63■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.62■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 NIM1KQ8IY84 436 aa24.62■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.62■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 POLLQ9UGP5 575 aa24.61■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 HSPA6P17066 643 aa24.6■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 TMC4Q7Z404 712 aa24.6■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 RIMBP2O15034 1052 aa24.59■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 FAM161AQ3B820 660 aa24.59■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.59■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 CACNA1FO60840 1977 aa24.59■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 LTBP1Q14766 1721 aa24.58■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 CEP350Q5VT06 3117 aa24.58■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 C6orf229H3BNL8 230 aa24.58■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.58■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.58■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
UPP1-205ENST00000417464 HTRA3P83110 453 aa24.57■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.57■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 GPC2Q8N158 579 aa24.56■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.56■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.56■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.56■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 SPEF2Q9C093 1822 aa24.56■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 YDJCA8MPS7 323 aa24.55■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 RAD17O75943 681 aa24.55■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 UFL1O94874 794 aa24.55■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.55■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.55■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.55■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.55■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 GRM8O00222 908 aa24.54■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 ITGA6P23229 1130 aa24.54■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 FOXO4P98177 505 aa24.54■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 CXCL9Q07325 125 aa24.54■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 DOK7Q18PE1 504 aa24.54■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 WASHC4Q2M389 1173 aa24.54■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.54■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 RTL9Q8NET4 1388 aa24.54■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 MYH3P11055 1940 aa24.53■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 SCNN1DP51172 638 aa24.53■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 FSTL1Q12841 308 aa24.53■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 HACL1Q9UJ83 578 aa24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms