RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416453.6

GTF3C2-AS1-201, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GTF3C2-AS1, Length 863 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NEURL1BA8MQ27 555 aa13.06□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SSH1Q8WYL5 1049 aa13.06□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SNED1Q8TER0 1413 aa13.05□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRELPP51888 382 aa13.05□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCDC93Q567U6 631 aa13.05□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C9orf131Q5VYM1 1079 aa13.05□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SMC4Q9NTJ3 1288 aa13.05□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RNF181Q9P0P0 153 aa13.05□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZBED9Q6R2W3 1325 aa13.05□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ALDH1B1P30837 517 aa13.04□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C7orf43Q8WVR3 580 aa13.04□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TAOK3Q9H2K8 898 aa13.04□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SOGA3Q5TF21 947 aa13.03□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SLC4A10Q6U841 1118 aa13.03□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa13.03□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINS1Q8NG48 757 aa13.03□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CRAMP1Q96RY5 1269 aa13.03□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CDHR2Q9BYE9 1310 aa13.03□□□□□ -0.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LMNB1P20700 586 aa13.02□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GCKRQ14397 625 aa13.02□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ALDH1L2Q3SY69 923 aa13.02□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BEND3Q5T5X7 828 aa13.02□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DUOX1Q9NRD9 1551 aa13.02□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LTBP1Q14766 1721 aa13.02□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PDE8AO60658 829 aa13.01□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GRAPQ13588 217 aa13.01□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PTPRCP08575 1304 aa13.01□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LTBP3Q9NS15 1303 aa13.01□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COL4A5P29400 1685 aa13□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CASP7P55210 303 aa13□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CTSWP56202 376 aa13□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 H7C1W4 665 aa12.99□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RARSP54136 660 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCDC152Q4G0S7 254 aa12.99□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SEC31BQ9NQW1 1179 aa12.99□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa12.99□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A1B0GUL6 1792 aa12.99□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RTKN2Q8IZC4 609 aa12.98□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa12.98□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KIF16BQ96L93 1317 aa12.97□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GRM8O00222 908 aa12.97□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ALDH1L1O75891 902 aa12.97□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BBOX1O75936 387 aa12.97□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM161AQ3B820 660 aa12.97□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa12.97□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GREM2Q9H772 168 aa12.97□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RTL9Q8NET4 1388 aa12.96□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IARSP41252 1262 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SP8Q8IXZ3 490 aa12.96□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TTLL11Q8NHH1 800 aa12.96□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PSMD1Q99460 953 aa12.96□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PLA2G12BQ9BX93 195 aa12.96□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BCAR3O75815 825 aa12.95□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TMC4Q7Z404 712 aa12.95□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 WDR90Q96KV7 1748 aa12.94□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RPS8P62241 208 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 EPHA10Q5JZY3 1008 aa12.94□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa12.94□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MPNDQ8N594 471 aa12.94□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SUCLG2Q96I99 432 aa12.94□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NMRK2Q9NPI5 230 aa12.94□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TNNQ9UQP3 1299 aa12.94□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CHMP3Q9Y3E7 222 aa12.94□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF541Q9H0D2 1346 aa12.93□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PPIP5K2O43314 1243 aa12.93□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ITGA6P23229 1130 aa12.93□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GPSM2P81274 684 aa12.93□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FOXO4P98177 505 aa12.93□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 AOC3Q16853 763 aa12.93□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GRIPAP1Q4V328 841 aa12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms