RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 ATRNO75882 1429 aa5.16□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 SHTN1A0MZ66 631 aa5.16□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 ALDH1L1O75891 902 aa5.16□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 EIF6P56537 245 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 SARNPP82979 210 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 WDR78Q5VTH9 848 aa5.16□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF804AQ7Z570 1209 aa5.16□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 CFAP57Q96MR6 1250 aa5.16□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 CENPHQ9H3R5 247 aa5.16□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 MKNK2Q9HBH9 465 aa5.16□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 SWAP70Q9UH65 585 aa5.16□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 BCS1LQ9Y276 419 aa5.16□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 PTCH1Q13635 1447 aa5.16□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 ESPNB1AK53 854 aa5.15□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 HLA-DOAP06340 250 aa5.15□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 LINS1Q8NG48 757 aa5.15□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 WDR66Q8TBY9 1149 aa5.15□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 UBAC1Q9BSL1 405 aa5.15□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP5.15□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 BABAM1Q9NWV8 329 aa5.15□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 SH3TC1Q8TE82 1336 aa5.15□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 UBR1Q8IWV7 1749 aa5.15□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa5.15□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa5.15□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 MBD3O95983 291 aa5.15□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 RARSP54136 660 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 GSTO1P78417 241 aa5.15□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM182BQ5T319 152 aa5.15□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 SASS6Q6UVJ0 657 aa5.15□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 FEZ1Q99689 392 aa5.15□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKRD2Q9GZV1 360 aa5.15□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 CABP5Q9NP86 173 aa5.15□□□□□ -1.58
ANKRD28-202ENST00000412318 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP5.15□□□□□ -1.581e-6■■□□□ 13.4
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ANKRD28-202ENST00000412318 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 IL13P35225 146 aa5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 CLCN1P35523 988 aa5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 MSL1Q68DK7 614 aa5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 DPY19L2Q6NUT2 758 aa5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 LUZP1Q86V48 1076 aa5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 SUPT20HQ8NEM7 779 aa5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 GJA3Q9Y6H8 435 aa5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 PHKG2P15735 406 aa5.15□□□□□ -1.59
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ANKRD28-202ENST00000412318 PDE6BP35913 854 aa5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 SOGA3Q5TF21 947 aa5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 LMBR1LQ6UX01 489 aa5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 FOXD4L1Q9NU39 408 aa5.15□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa5.14□□□□□ -1.59
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ANKRD28-202ENST00000412318 GRM8O00222 908 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 INSRP06213 1382 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 MNAT1P51948 309 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 SIK1P57059 783 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 LARGE2Q8N3Y3 721 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 PHACTR3Q96KR7 559 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 BEGAINQ9BUH8 593 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM184BQ9ULE4 1060 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKARQ7Z5J8 1434 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 UQCRHLA0A096LP55 91 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC69A6NI79 296 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 MINDY4BA8MYZ0 360 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 A1BGP04217 495 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 UQCRHP07919 91 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 NAPBQ9H115 298 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 LGR6Q9HBX8 967 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 RGPD1P0DJD0 1748 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 DISP2A7MBM2 1401 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 RIMBP2O15034 1052 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 HOXB7P09629 217 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP2B3Q16720 1220 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 TICAM2Q86XR7 235 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM22Q8IYM9 498 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 BOLA2Q9H3K6 86 aa5.14□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 F8W031 263 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC175P0C221 793 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 NUTM1Q86Y26 1132 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 PPM1EQ8WY54 764 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 SMC3Q9UQE7 1217 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 ERBB3P21860 1342 aa5.13□□□□□ -1.59
ANKRD28-202ENST00000412318 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
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