RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410506.1

RNU6-1077P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1077, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1077P, Length 102 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CHAC2Q8WUX2 184 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ANAPC16Q96DE5 110 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SPON2Q9BUD6 331 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SAP130Q9H0E3 1048 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZIM2Q9NZV7 527 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PRKAG3Q9UGI9 489 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 STRIP2Q9ULQ0 834 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 WASLO00401 505 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FOXO3O43524 673 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ASMTLO95671 621 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ALFQ53S48 1182 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 C2orf27AQ580R0 203 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IER5LQ5T953 404 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KANK3Q6NY19 840 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ERAP2Q6P179 960 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 C16orf46Q6P387 395 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PODNQ7Z5L7 613 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KIAA0825Q8IV33 1275 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CPLX3Q8WVH0 158 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZDHHC16Q969W1 377 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CSRNP1Q96S65 589 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MUC3BQ9H195 1237 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RBSNQ9H1K0 784 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IFT122Q9HBG6 1241 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GINM1Q9NU53 330 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KBTBD4Q9NVX7 518 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZNF69Q9UC07 566 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MCM8Q9UJA3 840 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MSRB2Q9Y3D2 182 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NUB1Q9Y5A7 615 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CD2APQ9Y5K6 639 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GOLGA6CA6NDK9 693 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GOLGA6BA6NDN3 693 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ESPNB1AK53 854 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NBPF26B4DH59 902 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 OPLAHO14841 1288 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PDPK1O15530 556 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 AKAP10O43572 662 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HIP1RO75146 1068 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TCEA3O75764 348 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SLC10A3P09131 477 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GOLGA6DP0CG33 693 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PLCG2P16885 1265 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IGFBP4P22692 258 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 VARSP26640 1264 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 STAT3P40763 770 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CASP2P42575 452 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ST13P50502 369 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GUCY2FP51841 1108 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NFKB2Q00653 900 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PTK2Q05397 1052 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CCDC93Q567U6 631 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FAM83BQ5T0W9 1011 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ANO1Q5XXA6 986 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DESI1Q6ICB0 168 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CASC1Q6TDU7 716 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ARMCX6Q7L4S7 300 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RETREG3Q86VR2 466 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CPXCR1Q8N123 301 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TATDN2Q93075 761 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ADAM33Q9BZ11 813 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LRRC27Q9C0I9 530 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ST7Q9NRC1 585 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 LUZP4Q9P127 313 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 STIM2Q9P246 746 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PCDH10Q9P2E7 1040 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 TSKSQ9UJT2 592 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HDAC9Q9UKV0 1011 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PNMA3Q9UL41 463 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PLAAQ9Y263 795 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 M0R2N6 131 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KATNA1O75449 491 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 F2P00734 622 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SRGNP10124 158 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RRM1P23921 792 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SOX9P48436 509 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NEK2P51955 445 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FUT2Q10981 343 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ORC1Q13415 861 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MLC1Q15049 377 aa3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms