RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 UNC5CLQ8IV45 518 aa4.87□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 CDAN1Q8IWY9 1227 aa4.87□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 PLBD2Q8NHP8 589 aa4.87□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 KLHDC4Q8TBB5 520 aa4.87□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 KIF2CQ99661 725 aa4.87□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 USP26Q9BXU7 913 aa4.87□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 ZBTB3Q9H5J0 574 aa4.87□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 UTYO14607 1347 aa4.87□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa4.87□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 REC8O95072 547 aa4.86□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJC10Q8IXB1 793 aa4.86□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 ERC1Q8IUD2 1116 aa4.86□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 ATG3Q9NT62 314 aa4.86□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 CHMP3Q9Y3E7 222 aa4.86□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 SASH1O94885 1247 aa4.86□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 STARD3NLO95772 234 aa4.85□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 SNX21Q969T3 373 aa4.85□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa4.85□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 ANO2Q9NQ90 1003 aa4.85□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 TMC2Q8TDI7 906 aa4.85□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 ANTXR1Q9H6X2 564 aa4.85□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 CNTROBQ8N137 903 aa4.85□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 ACSBG1Q96GR2 724 aa4.85□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 TNS2Q63HR2 1409 aa4.84□□□□□ -1.63
LRRTM4-201ENST00000409088 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa4.84□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 COPRSQ9NQ92 184 aa4.84□□□□□ -1.63
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LRRTM4-201ENST00000409088 TCIRG1Q13488 830 aa4.84□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 BOLA2Q9H3K6 86 aa4.84□□□□□ -1.64
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LRRTM4-201ENST00000409088 GPTP24298 496 aa4.83□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 TPRNQ4KMQ1 711 aa4.83□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNV2Q8TDN2 545 aa4.83□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM89AQ96GI7 184 aa4.83□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 C8orf37Q96NL8 207 aa4.83□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
LRRTM4-201ENST00000409088 HS3ST6Q96QI5 342 aa4.83□□□□□ -1.64
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