RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.97■■□□□ 1.27
USP39-202ENST00000409025 RAD50Q92878 1312 aa22.96■■□□□ 1.27
USP39-202ENST00000409025 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
USP39-202ENST00000409025 SYNE4Q8N205 404 aa22.96■■□□□ 1.27
USP39-202ENST00000409025 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.96■■□□□ 1.27
USP39-202ENST00000409025 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
USP39-202ENST00000409025 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.96■■□□□ 1.27
USP39-202ENST00000409025 FSD1Q9BTV5 496 aa22.96■■□□□ 1.27
USP39-202ENST00000409025 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
USP39-202ENST00000409025 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
USP39-202ENST00000409025 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.96■■□□□ 1.27
USP39-202ENST00000409025 MYH3P11055 1940 aa22.95■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 PDE8AO60658 829 aa22.95■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 CAMTA2O94983 1202 aa22.95■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 HSPA4P34932 840 aa22.95■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 CTSWP56202 376 aa22.95■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.95■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 IL17RAQ96F46 866 aa22.95■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 AFF2P51816 1311 aa22.94■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 PALD1Q9ULE6 856 aa22.94■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 ZNF609O15014 1411 aa22.94■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 PARP10Q53GL7 1025 aa22.93■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 AK7Q96M32 723 aa22.93■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.92■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 TIMM10P62072 90 aa22.92■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 HAUS7Q99871 368 aa22.92■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.92■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 NHSQ6T4R5 1651 aa22.92■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 ITGA6P23229 1130 aa22.92■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.92■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 A0A1B0GUL7 405 aa22.91■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 DDIT3P35638 169 aa22.91■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 NEK4P51957 841 aa22.91■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 SUSD4Q5VX71 490 aa22.91■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 IL27Q8NEV9 243 aa22.91■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 GREM2Q9H772 168 aa22.91■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.91■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 BTAF1O14981 1849 aa22.91■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.91■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.9■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 FAM227BQ96M60 508 aa22.9■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.9■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 ATRNO75882 1429 aa22.89■■□□□ 1.26
USP39-202ENST00000409025 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 MCM2P49736 904 aa22.89■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.89■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 SNRKQ9NRH2 765 aa22.89■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.88■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 BCORQ6W2J9 1755 aa22.88■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.87■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.87■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.87■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.87■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 A0A0D9SFI3 127 aa22.86■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 FAM177BA6PVY3 158 aa22.86■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 PTH1RQ03431 593 aa22.86■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 FAM182BQ5T319 152 aa22.86■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.86■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 KCNQ4P56696 695 aa22.86■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 METTL24Q5JXM2 366 aa22.86■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.86■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.86■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.85■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 GORABQ5T7V8 394 aa22.85■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.85■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 TICAM2Q86XR7 235 aa22.84■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.84■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.84■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 MED23Q9ULK4 1368 aa22.84■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 RGL2O15211 777 aa22.84■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 NTSR2O95665 410 aa22.84■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.84■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 XAGE2Q96GT9 111 aa22.84■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
USP39-202ENST00000409025 GOLIM4O00461 696 aa22.82■■□□□ 1.24
USP39-202ENST00000409025 ATP2B3Q16720 1220 aa22.82■■□□□ 1.24
USP39-202ENST00000409025 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.82■■□□□ 1.24
USP39-202ENST00000409025 MAP4K1Q92918 833 aa22.82■■□□□ 1.24
USP39-202ENST00000409025 SPEF2Q9C093 1822 aa22.82■■□□□ 1.24
USP39-202ENST00000409025 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
USP39-202ENST00000409025 RPS6KA4O75676 772 aa22.82■■□□□ 1.24
USP39-202ENST00000409025 KCNJ4P48050 445 aa22.82■■□□□ 1.24
USP39-202ENST00000409025 RASEFQ8IZ41 740 aa22.82■■□□□ 1.24
USP39-202ENST00000409025 KCNB2Q92953 911 aa22.82■■□□□ 1.24
USP39-202ENST00000409025 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
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