RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 BAG6P46379 1132 aa25.27■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.27■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.27■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 NYXQ9GZU5 481 aa25.27■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.26■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 ERFEQ4G0M1 354 aa25.26■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 NPHP1O15259 732 aa25.25■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 GYS1P13807 737 aa25.25■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 GREM2Q9H772 168 aa25.25■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 SASH1O94885 1247 aa25.24■■□□□ 1.63
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ATG4B-204ENST00000402096 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.24■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.23■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 ITGA6P23229 1130 aa25.23■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 NFIXQ14938 502 aa25.23■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.23■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.23■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.23■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 MX1P20591 662 aa25.22■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 SPEF2Q9C093 1822 aa25.21■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 EYA2O00167 538 aa25.21■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.21■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 PDE1AP54750 535 aa25.2■■□□□ 1.63
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.2■■□□□ 1.63
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ATG4B-204ENST00000402096 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 TFCP2Q12800 502 aa25.2■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 LRRC24Q50LG9 513 aa25.2■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 AACSQ86V21 672 aa25.2■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 STK32BQ9NY57 414 aa25.2■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 ABCC12Q96J65 1359 aa25.19■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 BMP2KLQ5H9B9 411 aa25.19■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 TTC22Q5TAA0 569 aa25.19■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 BACH2Q9BYV9 841 aa25.19■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.18■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 CIAO1O76071 339 aa25.18■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 C8orf34Q49A92 452 aa25.18■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.18■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.18■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.18■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.18■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.17■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 SLC15A2Q16348 729 aa25.17■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 CNBD1Q8NA66 436 aa25.17■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25.17■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 FBXO3Q9UK99 471 aa25.17■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.16■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.16■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.16■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 TM4SF1P30408 202 aa25.15■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 NLRP3Q96P20 1036 aa25.15■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.15■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 STAP2Q9UGK3 403 aa25.15■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 SERPINB2P05120 415 aa25.14■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 TNNI3KQ59H18 835 aa25.14■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.14■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 GPATCH3Q96I76 525 aa25.14■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.14■■□□□ 1.62
ATG4B-204ENST00000402096 TAF1P21675 1872 aa25.14■■□□□ 1.61
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ATG4B-204ENST00000402096 RTL9Q8NET4 1388 aa25.13■■□□□ 1.61
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC125Q86Z20 511 aa25.13■■□□□ 1.61
ATG4B-204ENST00000402096 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.13■■□□□ 1.61
ATG4B-204ENST00000402096 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.13■■□□□ 1.61
ATG4B-204ENST00000402096 AOX1Q06278 1338 aa25.13■■□□□ 1.61
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ATG4B-204ENST00000402096 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
ATG4B-204ENST00000402096 LRP5O75197 1615 aa25.11■■□□□ 1.61
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ATG4B-204ENST00000402096 DDR1Q08345 913 aa25.11■■□□□ 1.61
ATG4B-204ENST00000402096 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.11■■□□□ 1.61
ATG4B-204ENST00000402096 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.11■■□□□ 1.61
ATG4B-204ENST00000402096 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.11■■□□□ 1.61
ATG4B-204ENST00000402096 METTL24Q5JXM2 366 aa25.1■■□□□ 1.61
ATG4B-204ENST00000402096 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
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ATG4B-204ENST00000402096 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.1■■□□□ 1.61
ATG4B-204ENST00000402096 ERC2O15083 957 aa25.09■■□□□ 1.61
ATG4B-204ENST00000402096 MSL1Q68DK7 614 aa25.09■■□□□ 1.61
ATG4B-204ENST00000402096 GPR108Q9NPR9 543 aa25.09■■□□□ 1.61
ATG4B-204ENST00000402096 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.09■■□□□ 1.61
ATG4B-204ENST00000402096 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.08■■□□□ 1.61
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.08■■□□□ 1.61
ATG4B-204ENST00000402096 SDSP20132 328 aa25.08■■□□□ 1.61
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF609O15014 1411 aa25.08■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.07■■□□□ 1.6
ATG4B-204ENST00000402096 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.07■■□□□ 1.6
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