RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 CRAMP1Q96RY5 1269 aa37.98■■■■□ 3.67
PKDCC-202ENST00000401498 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
PKDCC-202ENST00000401498 PLIN1O60240 522 aa37.97■■■■□ 3.67
PKDCC-202ENST00000401498 RLBP1P12271 317 aa37.97■■■■□ 3.67
PKDCC-202ENST00000401498 CTSWP56202 376 aa37.97■■■■□ 3.67
PKDCC-202ENST00000401498 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM57Q8N5G2 664 aa37.96■■■■□ 3.67
PKDCC-202ENST00000401498 TTLL11Q8NHH1 800 aa37.96■■■■□ 3.67
PKDCC-202ENST00000401498 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP37.94■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 DCAF8L1A6NGE4 600 aa37.93■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 FOXO4P98177 505 aa37.93■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC152Q4G0S7 254 aa37.93■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 EPHA10Q5JZY3 1008 aa37.93■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 KAZALD1Q96I82 304 aa37.93■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 SUCLG2Q96I99 432 aa37.93■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 COL4A1P02462 1669 aa37.92■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 CSF1RP07333 972 aa37.91■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 C7orf43Q8WVR3 580 aa37.91■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 SEC31BQ9NQW1 1179 aa37.9■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 C21orf2O43822 256 aa37.89■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 GRIN3BO60391 1043 aa37.89■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 PANK1Q8TE04 598 aa37.89■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 GRAPQ13588 217 aa37.89■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP37.89■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 MEIS3Q99687 375 aa37.89■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 GREM2Q9H772 168 aa37.89■■■■□ 3.66
PKDCC-202ENST00000401498 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.65
PKDCC-202ENST00000401498 RTL9Q8NET4 1388 aa37.86■■■■□ 3.65
PKDCC-202ENST00000401498 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
PKDCC-202ENST00000401498 MS4A1P11836 297 aa37.85■■■■□ 3.65
PKDCC-202ENST00000401498 LMBR1LQ6UX01 489 aa37.85■■■■□ 3.65
PKDCC-202ENST00000401498 OLFM4Q6UX06 510 aa37.85■■■■□ 3.65
PKDCC-202ENST00000401498 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
PKDCC-202ENST00000401498 BBOX1O75936 387 aa37.85■■■■□ 3.65
PKDCC-202ENST00000401498 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
PKDCC-202ENST00000401498 SLC51AQ86UW1 340 aa37.85■■■■□ 3.65
PKDCC-202ENST00000401498 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP37.85■■■■□ 3.65
PKDCC-202ENST00000401498 FAM161AQ3B820 660 aa37.84■■■■□ 3.65
PKDCC-202ENST00000401498 ITPRIPQ8IWB1 547 aa37.84■■■■□ 3.65
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa37.82■■■■□ 3.65
PKDCC-202ENST00000401498 RPS8P62241 208 aaKnown RBP37.81■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 C20orf194Q5TEA3 1177 aa37.81■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 ANKRD44Q8N8A2 993 aa37.81■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 GNAI3P08754 354 aa37.8■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 ITGA6P23229 1130 aa37.8■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa37.8■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 CHMP3Q9Y3E7 222 aa37.8■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa37.8■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 PDE3AQ14432 1141 aa37.79■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 SOGA3Q5TF21 947 aa37.78■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 RRP1P56182 461 aaKnown RBP37.77■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 SP8Q8IXZ3 490 aa37.77■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP37.77■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 SNED1Q8TER0 1413 aa37.77■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC93Q567U6 631 aa37.76■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 TMC4Q7Z404 712 aa37.76■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 COG6Q9Y2V7 657 aa37.76■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 SPEF2Q9C093 1822 aa37.76■■■■□ 3.64
PKDCC-202ENST00000401498 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa37.76■■■■□ 3.63
PKDCC-202ENST00000401498 HDAC5Q9UQL6 1122 aa37.76■■■■□ 3.63
PKDCC-202ENST00000401498 LRRC37AA6NMS7 1700 aa37.75■■■■□ 3.63
PKDCC-202ENST00000401498 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
PKDCC-202ENST00000401498 MVPQ14764 893 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
PKDCC-202ENST00000401498 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa37.75■■■■□ 3.63
PKDCC-202ENST00000401498 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa37.74■■■■□ 3.63
PKDCC-202ENST00000401498 NFKBIEO00221 500 aa37.74■■■■□ 3.63
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC57Q2TAC2 916 aa37.72■■■■□ 3.63
PKDCC-202ENST00000401498 RTKN2Q8IZC4 609 aa37.72■■■■□ 3.63
PKDCC-202ENST00000401498 SBF1O95248 1867 aa37.71■■■■□ 3.63
PKDCC-202ENST00000401498 RASSF7Q02833 373 aa37.71■■■■□ 3.63
PKDCC-202ENST00000401498 GNAI2P04899 355 aa37.7■■■■□ 3.63
PKDCC-202ENST00000401498 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP37.7■■■■□ 3.63
PKDCC-202ENST00000401498 CHD4Q14839 1912 aa37.7■■■■□ 3.63
PKDCC-202ENST00000401498 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP37.69■■■■□ 3.62
PKDCC-202ENST00000401498 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
PKDCC-202ENST00000401498 DDX19BQ9UMR2 479 aa37.68■■■■□ 3.62
PKDCC-202ENST00000401498 PRELPP51888 382 aa37.68■■■■□ 3.62
PKDCC-202ENST00000401498 TAOK3Q9H2K8 898 aa37.68■■■■□ 3.62
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa37.67■■■■□ 3.62
PKDCC-202ENST00000401498 GRIPAP1Q4V328 841 aa37.67■■■■□ 3.62
PKDCC-202ENST00000401498 LTBP3Q9NS15 1303 aa37.66■■■■□ 3.62
PKDCC-202ENST00000401498 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP37.66■■■■□ 3.62
PKDCC-202ENST00000401498 MPHOSPH8Q99549 860 aa37.65■■■■□ 3.62
PKDCC-202ENST00000401498 MPNDQ8N594 471 aa37.64■■■■□ 3.62
PKDCC-202ENST00000401498 PSMD1Q99460 953 aa37.64■■■■□ 3.62
PKDCC-202ENST00000401498 C1orf115Q9H7X2 142 aa37.64■■■■□ 3.62
PKDCC-202ENST00000401498 TAF7LQ5H9L4 462 aa37.63■■■■□ 3.62
PKDCC-202ENST00000401498 MINPP1Q9UNW1 487 aa37.63■■■■□ 3.62
PKDCC-202ENST00000401498 LTBP1Q14766 1721 aa37.63■■■■□ 3.61
PKDCC-202ENST00000401498 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
PKDCC-202ENST00000401498 GPSM2P81274 684 aa37.63■■■■□ 3.61
PKDCC-202ENST00000401498 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.61
PKDCC-202ENST00000401498 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms