RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 CCT4P50991 539 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 GRAPQ13588 217 aa19.44■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 C7orf43Q8WVR3 580 aa19.44■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 PLA2G12BQ9BX93 195 aa19.43■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 SLX4Q8IY92 1834 aa19.43■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCC4O15439 1325 aa19.43■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 BCAR3O75815 825 aa19.42■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 CTSWP56202 376 aa19.42■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 CASP7P55210 303 aa19.41■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa19.41■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 TAOK3Q9H2K8 898 aa19.41■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 HDAC5Q9UQL6 1122 aa19.41■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa19.41■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 LMNB1P20700 586 aa19.4■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 RPS8P62241 208 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa19.4■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 SP8Q8IXZ3 490 aa19.4■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 TTLL11Q8NHH1 800 aa19.4■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 LTBP3Q9NS15 1303 aa19.4■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 KIF3CO14782 793 aa19.39■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 NFKBIEO00221 500 aa19.38■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 LAMB2P55268 1798 aa19.38■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP19.38■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 C9orf131Q5VYM1 1079 aa19.38■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa19.38■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 RTL9Q8NET4 1388 aa19.37■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 UTYO14607 1347 aa19.37■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 CSF1RP07333 972 aa19.37■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF181Q9P0P0 153 aa19.37■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 RCAN3Q9UKA8 241 aa19.37■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM27P14373 513 aa19.36■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 RASSF7Q02833 373 aa19.36■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 SUPT20HQ8NEM7 779 aa19.36■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 PSMD1Q99460 953 aa19.36■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 USP44Q9H0E7 712 aa19.36■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 GREM2Q9H772 168 aa19.36■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 SEC31BQ9NQW1 1179 aa19.36■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 CACNA1SQ13698 1873 aa19.36■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 MS4A1P11836 297 aa19.35■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 HSPA6P17066 643 aa19.35■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 OLFM4Q6UX06 510 aa19.35■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 MPNDQ8N594 471 aa19.35■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 NMRK2Q9NPI5 230 aa19.35■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa19.34■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 FOXO4P98177 505 aa19.34■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 LMBR1LQ6UX01 489 aa19.34■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 CHMP3Q9Y3E7 222 aa19.34■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 MYH3P11055 1940 aa19.33■□□□□ 0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 ITGA6P23229 1130 aa19.33■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC57Q2TAC2 916 aa19.33■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 CLUAP1Q96AJ1 413 aa19.33■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 VPS33BQ9H267 617 aa19.33■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa19.33■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 GNAI3P08754 354 aa19.32■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM161AQ3B820 660 aa19.32■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 SUCLG2Q96I99 432 aa19.32■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 MPHOSPH8Q99549 860 aa19.32■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 TAF7LQ5H9L4 462 aa19.31■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 IARSP41252 1262 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 EPHA10Q5JZY3 1008 aa19.3■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 JDP2Q8WYK2 163 aa19.3■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa19.3■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 SBF1O95248 1867 aa19.3■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 TAF1P21675 1872 aa19.28■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 SNED1Q8TER0 1413 aa19.28■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 PRELPP51888 382 aa19.28■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 LARGE2Q8N3Y3 721 aa19.28■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 KAZALD1Q96I82 304 aa19.28■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 EYA3Q99504 573 aa19.28■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD2Q9GZV1 360 aa19.28■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 PODXL2Q9NZ53 605 aa19.28■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 C6orf229H3BNL8 230 aa19.27■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 PPIP5K2O43314 1243 aa19.27■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 GPSM2P81274 684 aa19.27■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 DPY19L2Q6NUT2 758 aa19.27■□□□□ 0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM57Q8N5G2 664 aa19.27■□□□□ 0.68
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