RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa34.36■■■■□ 3.09
TPGS1-201ENST00000359315 CASP7P55210 303 aa34.35■■■■□ 3.09
TPGS1-201ENST00000359315 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
TPGS1-201ENST00000359315 SEC31BQ9NQW1 1179 aa34.35■■■■□ 3.09
TPGS1-201ENST00000359315 ALDH1L2Q3SY69 923 aa34.34■■■■□ 3.09
TPGS1-201ENST00000359315 SMC4Q9NTJ3 1288 aa34.34■■■■□ 3.09
TPGS1-201ENST00000359315 CACNA1FO60840 1977 aa34.34■■■■□ 3.09
TPGS1-201ENST00000359315 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa34.33■■■■□ 3.09
TPGS1-201ENST00000359315 SLC4A10Q6U841 1118 aa34.33■■■■□ 3.09
TPGS1-201ENST00000359315 BBOX1O75936 387 aa34.32■■■■□ 3.08
TPGS1-201ENST00000359315 CTSWP56202 376 aa34.32■■■■□ 3.08
TPGS1-201ENST00000359315 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
TPGS1-201ENST00000359315 PSMD1Q99460 953 aa34.3■■■■□ 3.08
TPGS1-201ENST00000359315 TAF1P21675 1872 aa34.3■■■■□ 3.08
TPGS1-201ENST00000359315 TIAM2Q8IVF5 1701 aa34.3■■■■□ 3.08
TPGS1-201ENST00000359315 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
TPGS1-201ENST00000359315 SP8Q8IXZ3 490 aa34.29■■■■□ 3.08
TPGS1-201ENST00000359315 PTPRCP08575 1304 aa34.29■■■■□ 3.08
TPGS1-201ENST00000359315 ZBED9Q6R2W3 1325 aa34.29■■■■□ 3.08
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC152Q4G0S7 254 aa34.28■■■■□ 3.08
TPGS1-201ENST00000359315 TTLL11Q8NHH1 800 aa34.28■■■■□ 3.08
TPGS1-201ENST00000359315 NMRK2Q9NPI5 230 aa34.28■■■■□ 3.08
TPGS1-201ENST00000359315 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
TPGS1-201ENST00000359315 RARSP54136 660 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
TPGS1-201ENST00000359315 COL4A5P29400 1685 aa34.27■■■■□ 3.08
TPGS1-201ENST00000359315 IARSP41252 1262 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
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TPGS1-201ENST00000359315 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa34.25■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 GREM2Q9H772 168 aa34.25■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 RPS8P62241 208 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 KIF3CO14782 793 aa34.23■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 ALDH1L1O75891 902 aa34.23■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa34.22■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC37AA6NMS7 1700 aa34.22■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 GRM8O00222 908 aa34.22■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 MPNDQ8N594 471 aa34.22■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 DUOX1Q9NRD9 1551 aa34.22■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 GLTPD2A6NH11 291 aa34.21■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 GRIPAP1Q4V328 841 aa34.21■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 TMC4Q7Z404 712 aa34.21■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 FAM161AQ3B820 660 aa34.2■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 EPHA10Q5JZY3 1008 aa34.2■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF541Q9H0D2 1346 aa34.2■■■■□ 3.07
TPGS1-201ENST00000359315 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
TPGS1-201ENST00000359315 GPSM2P81274 684 aa34.19■■■■□ 3.06
TPGS1-201ENST00000359315 KDM2BQ8NHM5 1336 aa34.19■■■■□ 3.06
TPGS1-201ENST00000359315 FOXO4P98177 505 aa34.18■■■■□ 3.06
TPGS1-201ENST00000359315 AOC3Q16853 763 aa34.18■■■■□ 3.06
TPGS1-201ENST00000359315 RTL9Q8NET4 1388 aa34.18■■■■□ 3.06
TPGS1-201ENST00000359315 CSF1RP07333 972 aa34.17■■■■□ 3.06
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa34.17■■■■□ 3.06
TPGS1-201ENST00000359315 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
TPGS1-201ENST00000359315 PPIP5K2O43314 1243 aa34.16■■■■□ 3.06
TPGS1-201ENST00000359315 BCAR3O75815 825 aa34.16■■■■□ 3.06
TPGS1-201ENST00000359315 DDNO94850 711 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
TPGS1-201ENST00000359315 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
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TPGS1-201ENST00000359315 RRAGCQ9HB90 399 aa34.16■■■■□ 3.06
TPGS1-201ENST00000359315 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
TPGS1-201ENST00000359315 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
TPGS1-201ENST00000359315 SUCLG2Q96I99 432 aa34.15■■■■□ 3.06
TPGS1-201ENST00000359315 ITGA6P23229 1130 aa34.14■■■■□ 3.06
TPGS1-201ENST00000359315 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
TPGS1-201ENST00000359315 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
TPGS1-201ENST00000359315 FZD9O00144 591 aa34.13■■■■□ 3.05
TPGS1-201ENST00000359315 KAZALD1Q96I82 304 aa34.13■■■■□ 3.05
TPGS1-201ENST00000359315 POLLQ9UGP5 575 aa34.13■■■■□ 3.05
TPGS1-201ENST00000359315 UTYO14607 1347 aa34.12■■■■□ 3.05
TPGS1-201ENST00000359315 POTECB2RU33 542 aa34.12■■■■□ 3.05
TPGS1-201ENST00000359315 SUPT20HQ8NEM7 779 aa34.12■■■■□ 3.05
TPGS1-201ENST00000359315 LTBP1Q14766 1721 aa34.11■■■■□ 3.05
TPGS1-201ENST00000359315 DPY19L2Q6NUT2 758 aa34.11■■■■□ 3.05
TPGS1-201ENST00000359315 JDP2Q8WYK2 163 aa34.11■■■■□ 3.05
TPGS1-201ENST00000359315 TNNQ9UQP3 1299 aa34.11■■■■□ 3.05
TPGS1-201ENST00000359315 KIF16BQ96L93 1317 aa34.1■■■■□ 3.05
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA2012Q0VF49 1180 aa34.1■■■■□ 3.05
TPGS1-201ENST00000359315 LMBR1LQ6UX01 489 aa34.1■■■■□ 3.05
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TPGS1-201ENST00000359315 C1QTNF8P60827 252 aa34.09■■■■□ 3.05
TPGS1-201ENST00000359315 NIM1KQ8IY84 436 aa34.09■■■■□ 3.05
TPGS1-201ENST00000359315 TBC1D16Q8TBP0 767 aa34.09■■■■□ 3.05
TPGS1-201ENST00000359315 USP44Q9H0E7 712 aa34.09■■■■□ 3.05
TPGS1-201ENST00000359315 MYH3P11055 1940 aa34.08■■■■□ 3.05
TPGS1-201ENST00000359315 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
TPGS1-201ENST00000359315 CHMP3Q9Y3E7 222 aa34.08■■■■□ 3.05
TPGS1-201ENST00000359315 C6orf229H3BNL8 230 aa34.07■■■■□ 3.04
TPGS1-201ENST00000359315 PODXL2Q9NZ53 605 aa34.07■■■■□ 3.04
TPGS1-201ENST00000359315 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
TPGS1-201ENST00000359315 VPS33BQ9H267 617 aa34.06■■■■□ 3.04
TPGS1-201ENST00000359315 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa34.06■■■■□ 3.04
TPGS1-201ENST00000359315 MINPP1Q9UNW1 487 aa34.06■■■■□ 3.04
TPGS1-201ENST00000359315 WDR90Q96KV7 1748 aa34.05■■■■□ 3.04
TPGS1-201ENST00000359315 RIMBP2O15034 1052 aa34.05■■■■□ 3.04
TPGS1-201ENST00000359315 UFL1O94874 794 aa34.05■■■■□ 3.04
TPGS1-201ENST00000359315 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa34.04■■■■□ 3.04
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