RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 SYT1P21579 422 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 GLI3P10071 1580 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 STX6O43752 255 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 OFD1O75665 1012 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 TFCP2Q12800 502 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM89AQ96GI7 184 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 SNRKQ9NRH2 765 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCC6O95255 1503 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 LARGE1O95461 756 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.45■■□□□ 1.19
SH3BP1-201ENST00000357436 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 HIP1O00291 1037 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 HLFQ16534 295 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM177BA6PVY3 158 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM182BQ5T319 152 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP4K1Q92918 833 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 TPM2P07951 284 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM227BQ96M60 508 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 SMIM5Q71RC9 77 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 TSPY26PQ9H489 355 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 CASP7P55210 303 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 C8orf37Q96NL8 207 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 PHF14O94880 888 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 F13A1P00488 732 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNQ2O43526 872 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 FOXO4P98177 505 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 DDB1Q16531 1140 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC24Q50LG9 513 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF214Q8ND24 703 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 GJB2P29033 226 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 ST3GAL1Q11201 340 aa22.4■■□□□ 1.18
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SH3BP1-201ENST00000357436 TIMM10P62072 90 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
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SH3BP1-201ENST00000357436 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A0D9SFI3 127 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 ME3Q16798 604 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 MTMR6Q9Y217 621 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC27A2O14975 620 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 TERF1P54274 439 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 UBE2HP62256 183 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 COPRSQ9NQ92 184 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 MED23Q9ULK4 1368 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 MCM5P33992 734 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 H7C1W4 665 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
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SH3BP1-201ENST00000357436 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
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SH3BP1-201ENST00000357436 STARD3NLO95772 234 aa22.36■■□□□ 1.17
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SH3BP1-201ENST00000357436 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 TNS2Q63HR2 1409 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 DISP2A7MBM2 1401 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 COL15A1P39059 1388 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP1-201ENST00000357436 TNNI3KQ59H18 835 aa22.35■■□□□ 1.17
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