RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
UPP1-201ENST00000331803 GPR108Q9NPR9 543 aa23.36■■□□□ 1.33
UPP1-201ENST00000331803 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.36■■□□□ 1.33
UPP1-201ENST00000331803 AK9Q5TCS8 1911 aa23.36■■□□□ 1.33
UPP1-201ENST00000331803 RPS6KA4O75676 772 aa23.35■■□□□ 1.33
UPP1-201ENST00000331803 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.35■■□□□ 1.33
UPP1-201ENST00000331803 AK7Q96M32 723 aa23.35■■□□□ 1.33
UPP1-201ENST00000331803 GREM2Q9H772 168 aa23.35■■□□□ 1.33
UPP1-201ENST00000331803 FAM177BA6PVY3 158 aa23.35■■□□□ 1.33
UPP1-201ENST00000331803 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.35■■□□□ 1.33
UPP1-201ENST00000331803 EVI5LQ96CN4 794 aa23.35■■□□□ 1.33
UPP1-201ENST00000331803 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.35■■□□□ 1.33
UPP1-201ENST00000331803 ITGA6P23229 1130 aa23.34■■□□□ 1.33
UPP1-201ENST00000331803 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.34■■□□□ 1.33
UPP1-201ENST00000331803 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.34■■□□□ 1.33
UPP1-201ENST00000331803 LY75O60449 1722 aa23.34■■□□□ 1.33
UPP1-201ENST00000331803 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.33■■□□□ 1.33
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.33■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 GNPATO15228 680 aa23.33■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 ATP5JP18859 108 aa23.33■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.33■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 MYH3P11055 1940 aa23.33■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 BCORQ6W2J9 1755 aa23.32■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 RGL2O15211 777 aa23.32■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 SMIM5Q71RC9 77 aa23.32■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 NTSR2O95665 410 aa23.31■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 TIMM10P62072 90 aa23.31■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.31■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.3■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 NARFQ9UHQ1 456 aa23.3■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 IL25Q9H293 177 aa23.29■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.29■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 EP400Q96L91 3159 aa23.29■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 BRWD3Q6RI45 1802 aa23.29■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 SGSM2O43147 1006 aa23.29■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.29■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.29■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.28■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 A0A1B0GUL7 405 aa23.28■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.28■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 SNX21Q969T3 373 aa23.28■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.28■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.28■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 ZNF609O15014 1411 aa23.28■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 ZPR1O75312 459 aa23.27■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.27■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.27■■□□□ 1.32
UPP1-201ENST00000331803 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 HSCBQ8IWL3 235 aa23.26■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.26■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 HIP1O00291 1037 aa23.25■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 TRIM37O94972 964 aa23.25■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 RABEP1Q15276 862 aa23.25■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.25■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.25■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 HAUS7Q99871 368 aa23.25■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 SCN7AQ01118 1682 aa23.25■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 METTL24Q5JXM2 366 aa23.25■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.25■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 FSD1Q9BTV5 496 aa23.25■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 C4BP0C0L5 1744 aa23.24■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 MCCP23508 829 aa23.24■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.24■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.23■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.23■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 ERFEQ4G0M1 354 aa23.22■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.22■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.22■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 SETDB2Q96T68 719 aa23.22■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23.22■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 RFC4P35249 363 aa23.21■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 XAGE2Q96GT9 111 aa23.21■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 RTL9Q8NET4 1388 aa23.21■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 PHF14O94880 888 aa23.21■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.21■■□□□ 1.31
UPP1-201ENST00000331803 LAMB2P55268 1798 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 ATP2B3Q16720 1220 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 GORABQ5T7V8 394 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 PDE8BO95263 885 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 ADORA1P30542 326 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 ANAPC15P60006 121 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 FAM227BQ96M60 508 aa23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms