RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.5■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.5■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 DNA2P51530 1060 aa21.5■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.5■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 ATP2B2Q01814 1243 aa21.49■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 SLU7O95391 586 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC175P0C221 793 aa21.49■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 UBASH3AP57075 661 aa21.49■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.49■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.49■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 IVLP07476 585 aa21.49■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC102BQ68D86 513 aa21.49■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 GAS2L3Q86XJ1 694 aa21.49■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.48■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.48■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.48■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.48■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 SYKP43405 635 aa21.48■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.48■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 KIAA0556O60303 1618 aa21.47■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 MCM6Q14566 821 aa21.47■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 RSPH14Q9UHP6 348 aa21.47■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.46■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 LIG1P18858 919 aa21.46■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC178Q5BJE1 867 aa21.46■■□□□ 1.03
PRKCI-201ENST00000295797 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 GRM8O00222 908 aa21.45■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.45■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 RUFY3Q7L099 469 aa21.45■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 NCOA7Q8NI08 942 aa21.45■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 FEZ1Q99689 392 aa21.45■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 PKP1Q13835 747 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 ADGRL2O95490 1459 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 CHST3Q7LGC8 479 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 VPS36Q86VN1 386 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.44■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 MAP3K12Q12852 859 aa21.43■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.43■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 ALS2CR12Q96Q35 445 aa21.43■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.43■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 GOPCQ9HD26 462 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 KSR2Q6VAB6 950 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 OGFRQ9NZT2 677 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 TUBB4AP04350 444 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 CAPN2P17655 700 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.42■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 ALDH1L1O75891 902 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 STARD3NLO95772 234 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 COPS6Q7L5N1 327 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 MAATS1Q7Z4T9 603 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 ZBTB9Q96C00 473 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 JADE2Q9NQC1 790 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 MYZAPP0CAP1 466 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 CTAGE15A4D2H0 777 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 CTAGE8P0CG41 777 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC91Q7Z6B0 441 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 CTAGE6Q86UF2 777 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 CTAGE4Q8IX94 777 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 GPTP24298 496 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 SLC39A6Q13433 755 aa21.41■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 APOBRQ0VD83 1088 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.4■■□□□ 1.02
PRKCI-201ENST00000295797 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 136.9 ms