RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.65■□□□□ 0.26
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CCDC42-201ENST00000293845 C1orf115Q9H7X2 142 aa16.54■□□□□ 0.24
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CCDC42-201ENST00000293845 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa16.53■□□□□ 0.24
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CCDC42-201ENST00000293845 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
CCDC42-201ENST00000293845 C21orf2O43822 256 aa16.52■□□□□ 0.24
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CCDC42-201ENST00000293845 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CCDC42-201ENST00000293845 MPHOSPH8Q99549 860 aa16.51■□□□□ 0.23
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CCDC42-201ENST00000293845 FBXO3Q9UK99 471 aa16.51■□□□□ 0.23
CCDC42-201ENST00000293845 GRIN3BO60391 1043 aa16.5■□□□□ 0.23
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CCDC42-201ENST00000293845 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
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