RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281623.7

FBXO4-201, Transcript of F-box protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXO4, Length 1,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4-201ENST00000281623 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
FBXO4-201ENST00000281623 TCIRG1Q13488 830 aa20.51■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.51■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 RGL2O15211 777 aa20.51■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 POLD1P28340 1107 aa20.5■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.5■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.5■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.49■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 COPRSQ9NQ92 184 aa20.49■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 SASH1O94885 1247 aa20.48■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 FOXO4P98177 505 aa20.48■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.48■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 CASC1Q6TDU7 716 aa20.48■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.48■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.47■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.47■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 MMP10P09238 476 aa20.46■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
FBXO4-201ENST00000281623 HLFQ16534 295 aa20.45■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.45■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.45■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 NFIXQ14938 502 aa20.45■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.45■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.45■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.45■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 SIL1Q9H173 461 aa20.45■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 TM4SF1P30408 202 aa20.44■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 SLC4A3P48751 1232 aa20.44■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.44■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 AK9Q5TCS8 1911 aa20.43■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.43■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 DDR1Q08345 913 aa20.43■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 BECN1Q14457 450 aa20.43■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.43■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.42■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 AACSQ86V21 672 aa20.42■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 SETDB2Q96T68 719 aa20.42■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.42■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.42■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 NLRP10Q86W26 655 aa20.41■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 RILPL2Q969X0 211 aa20.41■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 GPATCH3Q96I76 525 aa20.41■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.41■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 ERC2O15083 957 aa20.4■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 CHMLP26374 656 aa20.4■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 KIF2CQ99661 725 aa20.4■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 USP26Q9BXU7 913 aa20.39■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.39■□□□□ 0.86
FBXO4-201ENST00000281623 REC8O95072 547 aa20.38■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.38■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.38■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.38■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 SERPINB2P05120 415 aa20.38■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 GPTP24298 496 aa20.38■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.38■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 FAM89AQ96GI7 184 aa20.38■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 CNTROBQ8N137 903 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 TFCP2Q12800 502 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 PARP10Q53GL7 1025 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 TNNI3KQ59H18 835 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 MYH3P11055 1940 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 NPHP1O15259 732 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 CSF1RP07333 972 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 CNBD1Q8NA66 436 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 LAMB2P55268 1798 aa20.34■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 CIAO1O76071 339 aa20.34■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 KLHL34Q8N239 644 aa20.34■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 SNX21Q969T3 373 aa20.34■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 NYXQ9GZU5 481 aa20.34■□□□□ 0.85
FBXO4-201ENST00000281623 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms