RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
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UBE2B-201ENST00000265339 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.85■■□□□ 1.57
UBE2B-201ENST00000265339 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
UBE2B-201ENST00000265339 AKT1S1Q96B36 256 aa24.85■■□□□ 1.57
UBE2B-201ENST00000265339 PARP10Q53GL7 1025 aa24.84■■□□□ 1.57
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD45Q5TZF3 282 aa24.84■■□□□ 1.57
UBE2B-201ENST00000265339 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.84■■□□□ 1.57
UBE2B-201ENST00000265339 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.84■■□□□ 1.57
UBE2B-201ENST00000265339 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.83■■□□□ 1.57
UBE2B-201ENST00000265339 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.83■■□□□ 1.57
UBE2B-201ENST00000265339 FAM177BA6PVY3 158 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2B-201ENST00000265339 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2B-201ENST00000265339 LNPKQ9C0E8 428 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2B-201ENST00000265339 APBB1O00213 710 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE2B-201ENST00000265339 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
UBE2B-201ENST00000265339 NTSR2O95665 410 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2B-201ENST00000265339 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.81■■□□□ 1.56
UBE2B-201ENST00000265339 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.81■■□□□ 1.56
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UBE2B-201ENST00000265339 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.81■■□□□ 1.56
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UBE2B-201ENST00000265339 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
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UBE2B-201ENST00000265339 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.8■■□□□ 1.56
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UBE2B-201ENST00000265339 LAMB2P55268 1798 aa24.79■■□□□ 1.56
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UBE2B-201ENST00000265339 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2B-201ENST00000265339 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
UBE2B-201ENST00000265339 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2B-201ENST00000265339 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
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UBE2B-201ENST00000265339 GYS1P13807 737 aa24.77■■□□□ 1.56
UBE2B-201ENST00000265339 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.77■■□□□ 1.56
UBE2B-201ENST00000265339 SETDB2Q96T68 719 aa24.77■■□□□ 1.56
UBE2B-201ENST00000265339 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.76■■□□□ 1.55
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UBE2B-201ENST00000265339 PDE8AO60658 829 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2B-201ENST00000265339 CSF1RP07333 972 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2B-201ENST00000265339 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
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UBE2B-201ENST00000265339 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
UBE2B-201ENST00000265339 RAB11FIP3O75154 756 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2B-201ENST00000265339 NFIXQ14938 502 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
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UBE2B-201ENST00000265339 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2B-201ENST00000265339 SIL1Q9H173 461 aa24.73■■□□□ 1.55
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UBE2B-201ENST00000265339 ABCC12Q96J65 1359 aa24.71■■□□□ 1.55
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UBE2B-201ENST00000265339 SLC15A2Q16348 729 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2B-201ENST00000265339 GREM2Q9H772 168 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2B-201ENST00000265339 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2B-201ENST00000265339 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
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UBE2B-201ENST00000265339 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
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UBE2B-201ENST00000265339 SASH1O94885 1247 aa24.68■■□□□ 1.54
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UBE2B-201ENST00000265339 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
UBE2B-201ENST00000265339 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.66■■□□□ 1.54
UBE2B-201ENST00000265339 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.66■■□□□ 1.54
UBE2B-201ENST00000265339 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.66■■□□□ 1.54
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.66■■□□□ 1.54
UBE2B-201ENST00000265339 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
UBE2B-201ENST00000265339 DDR1Q08345 913 aa24.65■■□□□ 1.54
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UBE2B-201ENST00000265339 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.64■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 LRP5O75197 1615 aa24.64■■□□□ 1.53
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