RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258111.4

KCNMB4-201, Transcript of potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNMB4, Length 4,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4-201ENST00000258111 ABCF2Q9UG63 623 aa23.47■■□□□ 1.35
KCNMB4-201ENST00000258111 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
KCNMB4-201ENST00000258111 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.47■■□□□ 1.35
KCNMB4-201ENST00000258111 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNMB4-201ENST00000258111 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNMB4-201ENST00000258111 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNMB4-201ENST00000258111 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
KCNMB4-201ENST00000258111 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
KCNMB4-201ENST00000258111 SYT1P21579 422 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNMB4-201ENST00000258111 ATP8B2P98198 1209 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNMB4-201ENST00000258111 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNMB4-201ENST00000258111 AIDAQ96BJ3 306 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNMB4-201ENST00000258111 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.46■■□□□ 1.35
KCNMB4-201ENST00000258111 GPTP24298 496 aa23.45■■□□□ 1.35
KCNMB4-201ENST00000258111 AK2P54819 239 aa23.45■■□□□ 1.35
KCNMB4-201ENST00000258111 MICALCLQ6ZW33 695 aa23.45■■□□□ 1.35
KCNMB4-201ENST00000258111 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 KLHL10Q6JEL2 608 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 TOM1O60784 492 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.45■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 UBASH3AP57075 661 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 CHMLP26374 656 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 LUZP1Q86V48 1076 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 IP6K1Q92551 441 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 AOPEPQ8N6M6 819 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 TMX1Q9H3N1 280 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.44■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 SPA17Q15506 151 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 HOXC9P31274 260 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 SLC39A6Q13433 755 aa23.43■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 CTR9Q6PD62 1173 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 CPLX3Q8WVH0 158 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 CCDC102BQ68D86 513 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.42■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 YEATS4O95619 227 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 TSPYL6Q8N831 410 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.41■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 COPS6Q7L5N1 327 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 PTPRTO14522 1441 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 TAF4BQ92750 862 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 ALDH1L1O75891 902 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 BRF1Q92994 677 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.4■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 PAFAH1B1P43034 410 aa23.39■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
KCNMB4-201ENST00000258111 TUBB4BP68371 445 aa23.39■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 MCM6Q14566 821 aa23.39■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 MAP3K5Q99683 1374 aa23.39■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.39■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 KSR2Q6VAB6 950 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 GOLGA1Q92805 767 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 BRD1O95696 1058 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 ATP2B2Q01814 1243 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 USP16Q9Y5T5 823 aa23.38■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 SLC5A1P13866 664 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 IL2RBP14784 551 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 GPATCH11Q8N954 259 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 CAPN2P17655 700 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 SYKP43405 635 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 MAP3K12Q12852 859 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.37■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 CTAGE15A4D2H0 777 aa23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 CTAGE8P0CG41 777 aa23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 IL13P35225 146 aa23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 MNAT1P51948 309 aa23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 KANK3Q6NY19 840 aa23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 CTAGE6Q86UF2 777 aa23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 CTAGE4Q8IX94 777 aa23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.36■■□□□ 1.33
KCNMB4-201ENST00000258111 ISM2Q6H9L7 571 aa23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms