RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLSTN2Q9H4D0 955 aa25.09■■□□□ 1.61
CSNK1G2-201ENST00000255641 TPM3P06753 285 aa25.09■■□□□ 1.61
CSNK1G2-201ENST00000255641 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CSNK1G2-201ENST00000255641 CTNNA3Q9UI47 895 aa25.09■■□□□ 1.61
CSNK1G2-201ENST00000255641 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.08■■□□□ 1.61
CSNK1G2-201ENST00000255641 SASH1O94885 1247 aa25.08■■□□□ 1.61
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAP4K1Q92918 833 aa25.08■■□□□ 1.61
CSNK1G2-201ENST00000255641 BRF1Q92994 677 aa25.08■■□□□ 1.61
CSNK1G2-201ENST00000255641 PIK3C2AO00443 1686 aa25.07■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.07■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.07■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 EVI5LQ96CN4 794 aa25.07■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 ST7Q9NRC1 585 aa25.07■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 SMTNL1A8MU46 457 aa25.06■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZBTB22O15209 634 aa25.06■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 GUCY1B3Q02153 619 aa25.06■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 SUCLG2Q96I99 432 aa25.06■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 RPS6KB1P23443 525 aa25.05■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.05■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 CEP135Q66GS9 1140 aa25.05■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.04■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.04■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.04■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.03■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPATCH3Q96I76 525 aa25.03■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNB2Q92953 911 aa25.02■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 KAZALD1Q96I82 304 aa25.02■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 BTBD11A6QL63 1104 aa25.02■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 H3BQV1 296 aa25.02■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 IFFO2Q5TF58 517 aa25.02■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.02■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 NBPF4Q96M43 638 aa25.02■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa25.02■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 ELP1O95163 1332 aa25.02■■□□□ 1.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 OGFRQ9NZT2 677 aa25.01■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 LRRC8AQ8IWT6 810 aa25.01■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa25■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 SKILP12757 684 aa25■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 PDCP20941 246 aa25■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 ELF2Q15723 593 aa25■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 KMT5BQ4FZB7 885 aa25■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 PSMA5P28066 241 aa25■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 TEFQ10587 303 aa25■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 Q6ZUG5 572 aa24.99■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 LRRN4CLQ8ND94 238 aa24.99■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 COL15A1P39059 1388 aa24.99■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A0G2JLW4 131 aa24.99■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 RESTQ13127 1097 aa24.99■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 IQCB1Q15051 598 aa24.99■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.99■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.98■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIF20AO95235 890 aa24.98■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC69A6NI79 296 aa24.98■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.98■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHST3Q7LGC8 479 aa24.97■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIF18AQ8NI77 898 aa24.97■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.97■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERICH4A6NGS2 130 aa24.97■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 FGD1P98174 961 aa24.97■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 PTPN14Q15678 1187 aa24.96■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.96■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa24.96■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 FEZ1Q99689 392 aa24.96■■□□□ 1.59
CSNK1G2-201ENST00000255641 BECN2A8MW95 431 aa24.95■■□□□ 1.58
CSNK1G2-201ENST00000255641 TAF5LO75529 589 aa24.95■■□□□ 1.58
CSNK1G2-201ENST00000255641 AOPEPQ8N6M6 819 aa24.95■■□□□ 1.58
CSNK1G2-201ENST00000255641 SCRN1Q12765 414 aa24.95■■□□□ 1.58
CSNK1G2-201ENST00000255641 PTPN21Q16825 1174 aa24.95■■□□□ 1.58
CSNK1G2-201ENST00000255641 RNF20Q5VTR2 975 aa24.95■■□□□ 1.58
CSNK1G2-201ENST00000255641 GTF3C6Q969F1 213 aa24.95■■□□□ 1.58
CSNK1G2-201ENST00000255641 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.95■■□□□ 1.58
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.94■■□□□ 1.58
CSNK1G2-201ENST00000255641 NWD1Q149M9 1564 aa24.93■■□□□ 1.58
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLFN14P0C7P3 912 aa24.93■■□□□ 1.58
CSNK1G2-201ENST00000255641 MYL6BP14649 208 aa24.93■■□□□ 1.58
CSNK1G2-201ENST00000255641 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.1 ms