RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637548.1

ARID1B-226, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

Gene ARID1B, Length 2,255 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-226	ENST00000637548	WDR76	Q9H967	626 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	DUSP13	Q9UII6	198 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548		A0A0U1RQV5	110 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	SGK494	L7N484	410 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF195	O14628	629 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	EED	O75530	441 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	JRK	O75564	520 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	OR6A2	O95222	327 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	ITGA2	P17301	1181 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	PRPH2	P23942	346 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	OR1D4	P47884	311 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	BCAP31	P51572	246 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	BTN3A2	P78410	334 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	RELA	Q04206	551 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	GPR176	Q14439	515 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	PTGR1	Q14914	329 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	NAT6	Q93015	286 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	OR2A5	Q96R48	311 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	SP140L	Q9H930	580 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	FGF21	Q9NSA1	209 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	PISD	Q9UG56	409 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548		A0A1W2PS29	197 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	TLCD2	A6NGC4	264 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	FBP2	O00757	339 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	SDHD	O14521	159 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	KLF11	O14901	512 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	RNF13	O43567	381 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	RAD51D	O75771	328 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	MB	P02144	154 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	KLK1	P06870	262 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	HOXB5	P09067	269 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	THRA	P10827	490 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF28	P17035	718 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	EDN2	P20800	178 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	CERS1	P27544	350 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	CCR4	P51679	360 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF134	P52741	427 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	PKNOX1	P55347	436 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	ITGA1	P56199	1179 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	LOXL3	P58215	753 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	RAB14	P61106	215 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	SIRPA	P78324	504 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	HSD11B2	P80365	405 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	REEP5	Q00765	189 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	ID2	Q02363	134 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	CHRNE	Q04844	493 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	DUSP2	Q05923	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	NPTX1	Q15818	432 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	LIPJ	Q5W064	366 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms