RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 OR14I1A6ND48 311 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 ENO4A6NNW6 628 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 SULT2B1O00204 365 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 OR10H3O60404 316 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 NPIPB7O75200 414 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 CCNB2O95067 398 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 AHSA1O95433 338 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 TPOP07202 933 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 IFI30P13284 250 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 ABOP16442 354 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 PTGS2P35354 604 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 IDUAP35475 653 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 LIMS1P48059 325 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 CLK1P49759 484 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 MYBPHQ13203 477 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 OR7A5Q15622 319 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 BCL2A1Q16548 175 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 PDSS1Q5T2R2 415 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 WLSQ5T9L3 541 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 C1QL3Q5VWW1 255 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 HBMQ6B0K9 141 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 C5orf46Q6UWT4 87 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 NRMQ8IXM6 262 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 ICA1LQ8NDH6 482 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 OR4K5Q8NGD3 323 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 OR4C15Q8NGM1 316 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 OR5M9Q8NGP3 310 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 OR10D3Q8NH80 312 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 MED12Q93074 2177 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 TAAR8Q969N4 342 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A36Q96CQ1 311 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 FUZQ9BT04 418 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 PTDSS2Q9BVG9 487 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 POTEKPQ9BYX7 375 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 SLC19A3Q9BZV2 496 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 KLHL4Q9C0H6 718 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 NTN4Q9HB63 628 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa7.65□□□□□ -1.18
SGMS1-211ENST00000626236 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 LIPT2A6NK58 231 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 SAC3D1A6NKF1 404 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 LRRN3E7EW58 273 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 J3QL48 77 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 BCKDKO14874 412 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 SIAH2O43255 324 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 OR2T1O43869 369 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 CXCL13O43927 109 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 PMS2P2O95744 297 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 CH25HO95992 272 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 BGLAPP02818 100 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 IMPDH2P12268 514 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 ANPEPP15144 967 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 CPN1P15169 458 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF23P17027 643 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 FPR1P21462 350 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 CBLP22681 906 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 IFNGR2P38484 337 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 GPR4P46093 362 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 DIO1P49895 249 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 ARHGDIAP52565 204 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 HMGA2P52926 109 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 CTBP2P56545 445 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 CLDN15P56746 228 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 CARD18P57730 90 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 OR2B6P58173 313 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 PRR20EP86478 221 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 PRR20CP86479 221 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 PRR20DP86480 221 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 PRR20BP86481 221 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 PRR20AP86496 221 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 PRKCDQ05655 676 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 RBPJQ06330 500 aa7.64□□□□□ -1.19
SGMS1-211ENST00000626236 GK3PQ14409 553 aa7.64□□□□□ -1.19
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