RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	RAC3	P60763	192 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	NAE1	Q13564	534 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CSHL1	Q14406	222 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	STEAP4	Q687X5	459 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	FDX2	Q6P4F2	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	TANK	Q92844	425 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	MIOX	Q9UGB7	285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	AGRN	O00468	2067 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1W2PRD5	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1W2PRF3	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1W2PRM7	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061		H3BSH0	61 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CCL24	O00175	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	GPR171	O14626	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	NPFF	O15130	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	TM9SF1	O15321	606 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ZBTB14	O43829	449 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CLPTM1	O96005	669 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CHRNB2	P17787	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PON1	P27169	355 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC7A1	P30825	629 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ARR3	P36575	388 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	TCTA	P57738	103 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	IRF8	Q02556	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	TGM3	Q08188	693 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PNOC	Q13519	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	NDN	Q99608	321 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	TUBA4B	Q9H853	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SIX2	Q9NPC8	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1W2PRB8	838 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PHYH	O14832	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SPRY3	O43610	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PSPN	O60542	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	GPR75	O95800	540 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	OXT	P01178	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	DRD5	P21918	477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ELK4	P28324	431 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	SAA4	P35542	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	CRAT	P43155	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	PPIC	P45877	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF81	P51508	661 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNAP23-222	ENST00000626061	MVD	P53602	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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