RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 OR6C68A6NDL8 312 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 NOTOA8MTQ0 251 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 TCRBP04435 133 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 WNT1P04628 370 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 MMP15P51511 669 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 POU4F2Q12837 409 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF141Q15928 474 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 RPS4Y2Q8TD47 263 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 RASD2Q96D21 266 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 LMF1Q96S06 567 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 FBRSQ9HAH7 460 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 HCN3Q9P1Z3 774 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 LRIT1Q9P2V4 623 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 SPACA6W5XKT8 324 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 GIFP27352 417 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM255AQ5JRV8 349 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 SYS1Q8N2H4 156 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 MS4A15Q8N5U1 240 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 LGALS14Q8TCE9 139 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM2Q9C040 744 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 POT1Q9NUX5 634 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 NCDNQ9UBB6 729 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 SCML1Q9UN30 329 aa12.24□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 UBL3O95164 117 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 MT-ND4P03905 459 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 CT45A8P0DMV1 189 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 CT45A9P0DMV2 189 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 SIRPAP78324 504 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 ERV3-1Q14264 604 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 CT45A2Q5DJT8 189 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 OR4C3Q8NH37 302 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 OR14A16Q8NHC5 309 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 KLHDC3Q9BQ90 382 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM106CQ9BVX2 250 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 GSDMCQ9BYG8 508 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 BRD7Q9NPI1 651 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 GNG8Q9UK08 70 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 I3L1I5 382 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 PSMD9O00233 223 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 OR10H2O60403 315 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 NDUFB2O95178 105 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 CLPSP04118 112 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 OR2T7P0C7T2 308 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 TYRP1P17643 537 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 GNG2P59768 71 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 AVL9Q8NBF6 648 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 OR7G1Q8NGA0 311 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 OR2T27Q8NH04 317 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 ZFP3Q96NJ6 502 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 S1PR5Q9H228 398 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 CLEC1BQ9P126 229 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 LAMA1P25391 3075 aa12.23□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 IFNGP01579 166 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 SPI1P17947 270 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 GRPRP30550 384 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 BTG2P78543 158 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 CAMK2BQ13554 666 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 MANEAQ5SRI9 462 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 LINC01590Q5TEZ4 76 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 ULK3Q6PHR2 472 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 CREB3L2Q70SY1 520 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 SLC25A38Q96DW6 304 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 A0A087WUJ7 227 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 FLRT2O43155 660 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV4-34P06331 123 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 GUSBP08236 651 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 DIO1P49895 249 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 ST3GAL2Q16842 350 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF684Q5T5D7 378 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 TOMM5Q8N4H5 51 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 POMGNT2Q8NAT1 580 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 MOSPD2Q8NHP6 518 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 GPR137Q96N19 417 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 GPR174Q9BXC1 333 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 SLC25A18Q9H1K4 315 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
C9orf170-201ENST00000623052 OR5K3A6NET4 321 aa12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms