RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622020.4

NPHP4-211, Transcript of nephrocystin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NPHP4, Length 3,004 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4-211ENST00000622020 GAL3ST1Q99999 423 aa14.52□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 TEX101Q9BY14 249 aa14.52□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.52□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 CAMK2AQ9UQM7 478 aa14.52□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa14.52□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 TRIOO75962 3097 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 TBC1D3EA0A087X179 549 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 A0A1B0GWA3 101 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 SIGLEC5O15389 551 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 SRMP19623 302 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 EMDP50402 254 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 TNFRSF17Q02223 184 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 SIGLEC14Q08ET2 396 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 STX4Q12846 297 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 KCNAB1Q14722 419 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 OPCMLQ14982 345 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 CDK5R1Q15078 307 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 EIPR1Q53HC9 387 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 ALG10BQ5I7T1 473 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 CXorf58Q96LI9 332 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 LINC00052Q96N35 136 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 GSX2Q9BZM3 304 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 NOX3Q9HBY0 568 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 NUP50Q9UKX7 468 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 MCIDASD6RGH6 385 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 H0Y8X5 98 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 SLC35G6P0C7Q6 338 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 CXCL2P19875 107 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 ADH7P40394 386 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 CST6Q15828 149 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 FBXO42Q6P3S6 717 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 OR2L13Q8N349 312 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 SMIM19Q96E16 107 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 HSPA12BQ96MM6 686 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 JAM3Q9BX67 310 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 C12orf10Q9HB07 376 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 FGF22Q9HCT0 170 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 C2orf42Q9NWW7 574 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 PIN1P1O15428 100 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 ARPC5O15511 151 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 GMFGO60234 142 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 SLC2A5P22732 501 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 TAS2R43P59537 309 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 MELKQ14680 651 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 LINC00303Q3SY05 128 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 SLC22A10Q63ZE4 541 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 FAM198BQ6UWH4 519 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 RASD2Q96D21 266 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF350Q9GZX5 532 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 ARL6IP5O75915 188 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 LYPD3O95274 346 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 DBIP07108 87 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 CCL5P13501 91 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 PLA2G7Q13093 441 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 CLLU1Q5K131 121 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 ZNF511Q8NB15 262 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 GFI1Q99684 422 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 COPZ2Q9P299 210 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 A0A1B0GVI7 797 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 A0A1W2PQU0 124 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 L7N2F9 121 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 ACSM4P0C7M7 580 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 RRASP10301 218 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 SLC35F2Q8IXU6 374 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 ZBTB44Q8NCP5 570 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 SYNPRQ8TBG9 265 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 HGDQ93099 445 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 OR1F2PQ96R84 312 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 GINS4Q9BRT9 223 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 ABRACLQ9P1F3 81 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 OR5K3A6NET4 321 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 PCP4L1A6NKN8 68 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 TBC1D3LB9A6J9 549 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 H3BUI4 141 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 TRIM77I1YAP6 450 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 PTP4A3O75365 173 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 RASGRP1O95267 797 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 ATP1B1P05026 303 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-211ENST00000622020 TBC1D3HP0C7X1 549 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms