RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620631.4

GTF2I-217, Transcript of general transcription factor IIi, humanhuman

TSL 2

Gene GTF2I, Length 868 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2I-217ENST00000620631 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 ATG16L1Q676U5 607 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 FAM71E1Q6IPT2 247 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 TMEM107Q6UX40 140 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 GFRALQ6UXV0 394 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 C3P1Q6ZMU1 363 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 USP43Q70EL4 1123 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 SZRD1Q7Z422 152 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 GALNT10Q86SR1 603 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 CLYBLQ8N0X4 340 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 CNPY4Q8N129 248 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 LIX1Q8N485 282 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 ZNF615Q8N8J6 731 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 TMEM178AQ8NBL3 297 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 OR7G2Q8NG99 324 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 OR7A2PQ8NGA2 310 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 OR10G3Q8NGC4 313 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 OR4N2Q8NGD1 307 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 OR5L2Q8NGL0 311 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 FBXO30Q8TB52 745 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 SLC22A8Q8TCC7 542 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 NR4A3Q92570 626 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 TLCD1Q96CP7 247 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 MPP4Q96JB8 637 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 ART5Q96L15 291 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 SORT1Q99523 831 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 SLX1AQ9BQ83 275 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 TMBIM4Q9HC24 238 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 MYNNQ9NPC7 610 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 EQTNQ9NQ60 294 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 MIEF1Q9NQG6 463 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.619e-8■■■□□ 19.1
GTF2I-217ENST00000620631 MDFICQ9P1T7 246 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 SEC14L3Q9UDX4 400 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 PSME2Q9UL46 239 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 ICAM5Q9UMF0 924 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 GOLGA8OA6NCC3 632 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 C17orf51A8MQB3 221 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 TMEM114B3SHH9 223 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 FAM157AC9JC47 383 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 C9JVG2 144 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 GOLGA8NF8WBI6 632 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 H3BQF6 201 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 TFECO14948 347 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 TM9SF1O15321 606 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 BIRC5O15392 142 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 HS6ST1O60243 411 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 P04436 131 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 ATP1B1P05026 303 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 BCKDHAP12694 445 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 MT3P25713 68 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 NTSP30990 170 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 GPR12P47775 334 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 RFX3P48380 749 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 EMDP50402 254 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 CDK9P50750 372 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 NAA20P61599 178 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 PLCXD2Q0VAA5 305 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 FUT7Q11130 342 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 HEPACAMQ14CZ8 416 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 INAQ16352 499 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 TTMPQ5BVD1 217 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 XKR7Q5GH72 579 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 PIGGQ5H8A4 983 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 FHL5Q5TD97 284 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 IL23RQ5VWK5 629 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 OPN5Q6U736 354 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 NPSR1Q6W5P4 371 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 RTL4Q6ZR62 310 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 FAM47EQ6ZV65 393 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 FJX1Q86VR8 437 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 SIAH3Q8IW03 269 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 FAM9CQ8IZT9 166 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 ZNF441Q8N8Z8 693 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 FNDC5Q8NAU1 212 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 OR2M7Q8NG81 312 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 NUBPLQ8TB37 319 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 HTRA1Q92743 480 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 ADIPOR1Q96A54 375 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 PPCDCQ96CD2 204 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF2I-217ENST00000620631 TUBGCP3Q96CW5 907 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms