RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 MAP2K6P52564 334 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 CHRNB3Q05901 458 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 CHI3L2Q15782 390 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 PAQR6Q6TCH4 344 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 ANKFN1Q8N957 763 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 C20orf27Q9GZN8 174 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 SLC38A1Q9H2H9 487 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 RAP2CQ9Y3L5 183 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 WDR91A4D1P6 747 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 FAAHO00519 579 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 CSF3P09919 207 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
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PTPRF-216ENST00000617451 CYB5R2Q6BCY4 276 aa21.81■■□□□ 1.08
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PTPRF-216ENST00000617451 CCDC115Q96NT0 180 aa21.81■■□□□ 1.08
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PTPRF-216ENST00000617451 BTNL2Q9UIR0 455 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa21.81■■□□□ 1.08
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PTPRF-216ENST00000617451 CHRM4P08173 479 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 MPGP29372 298 aa21.8■■□□□ 1.08
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PTPRF-216ENST00000617451 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa21.8■■□□□ 1.08
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PTPRF-216ENST00000617451 ZIC4Q8N9L1 334 aa21.8■■□□□ 1.08
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PTPRF-216ENST00000617451 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.082e-12■■□□□ 13.4
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PTPRF-216ENST00000617451 LY6HO94772 140 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV4-31P0DP07 118 aa21.79■■□□□ 1.08
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PTPRF-216ENST00000617451 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
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PTPRF-216ENST00000617451 BOD1Q96IK1 185 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 TEX37Q96LM6 180 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 SORT1Q99523 831 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM109Q9BVC6 243 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 ADAM19Q9H013 955 aa21.79■■□□□ 1.08
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PTPRF-216ENST00000617451 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa21.78■■□□□ 1.08
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PTPRF-216ENST00000617451 CCDC154A6NI56 674 aa21.78■■□□□ 1.08
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PTPRF-216ENST00000617451 POMGNT2Q8NAT1 580 aa21.78■■□□□ 1.08
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PTPRF-216ENST00000617451 HAO1Q9UJM8 370 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 MOKQ9UQ07 419 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 LIPT2A6NK58 231 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 WNT11O96014 354 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 UQCRBP14927 111 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 IL7RP16871 459 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 SLC1A6P48664 564 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
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PTPRF-216ENST00000617451 TRIML2Q8N7C3 387 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 PANX1Q96RD7 426 aa21.77■■□□□ 1.08
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PTPRF-216ENST00000617451 GPIP06744 558 aa21.76■■□□□ 1.07
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PTPRF-216ENST00000617451 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
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PTPRF-216ENST00000617451 AAED1Q7RTV5 226 aa21.76■■□□□ 1.07
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PTPRF-216ENST00000617451 FBXO17Q96EF6 278 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 SHARPINQ9H0F6 387 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 PIF1Q9H611 641 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 MEAF6Q9HAF1 191 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRF-216ENST00000617451 AQP7P3A6NL99 342 aa21.75■■□□□ 1.07
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