RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 RLIMQ9NVW2 624 aa18.74■□□□□ 0.59
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CTDP1-208ENST00000613122 CAPNS1P04632 268 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 MPEG1Q2M385 716 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 FOXQ1Q9C009 403 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
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CTDP1-208ENST00000613122 CITO14578 2027 aa18.74■□□□□ 0.59
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CTDP1-208ENST00000613122 H0Y8X5 98 aa18.74■□□□□ 0.59
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CTDP1-208ENST00000613122 CNIH2Q6PI25 160 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
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CTDP1-208ENST00000613122 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
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CTDP1-208ENST00000613122 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
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CTDP1-208ENST00000613122 FAIMQ9NVQ4 179 aa18.73■□□□□ 0.59
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CTDP1-208ENST00000613122 SERPINA12Q8IW75 414 aa18.72■□□□□ 0.59
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CTDP1-208ENST00000613122 MYOTQ9UBF9 498 aa18.72■□□□□ 0.59
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CTDP1-208ENST00000613122 MARCH3Q86UD3 253 aa18.72■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
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CTDP1-208ENST00000613122 TMEM100Q9NV29 134 aa18.72■□□□□ 0.59
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CTDP1-208ENST00000613122 OR5T1Q8NG75 326 aa18.72■□□□□ 0.59
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CTDP1-208ENST00000613122 TMEM202A6NGA9 273 aa18.71■□□□□ 0.59
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CTDP1-208ENST00000613122 MSL3P1P0C860 447 aa18.71■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 SLC29A1Q99808 456 aa18.71■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 FUOMA2VDF0 154 aa18.71■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 CXCL10P02778 98 aa18.71■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 FCGR2AP12318 317 aa18.71■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa18.71■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF813Q6ZN06 617 aa18.71■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 SULF2Q8IWU5 870 aa18.71■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 PHC2Q8IXK0 858 aa18.71■□□□□ 0.59
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