RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608263.5

CTCFL-216, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 4,040 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-216ENST00000608263 PRKACBP22694 351 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 ACTC1P68032 377 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 ACTA1P68133 377 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 KLHL26Q53HC5 615 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF620Q6ZNG0 422 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 KIF18BQ86Y91 864 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 LINC01555Q8NAE3 123 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 POGLUT1Q8NBL1 392 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 NAXEQ8NCW5 288 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 NR4A3Q92570 626 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 UPRTQ96BW1 309 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 PIGUQ9H490 435 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 TRPV4Q9HBA0 871 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 RXFP3Q9NSD7 469 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 SIP14410 1827 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 SCDO00767 359 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 PLA2G10O15496 165 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 SCO2O43819 266 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 OLFM2O95897 454 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 F3P13726 295 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 OTX2P32243 289 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 PLPP6Q8IY26 295 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 CDRT4Q8N9R6 151 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 DNAAF1Q8NEP3 725 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 OR10H5Q8NGA6 315 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 TSSK2Q96PF2 358 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 CMKLR1Q99788 373 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 NOX4Q9NPH5 578 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 KLRF1Q9NZS2 232 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF236Q9UL36 1845 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 A0A1B0GWA3 101 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 H0YGG7 62 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 TNFRSF10AO00220 468 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 CFL1P23528 166 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 FPR3P25089 353 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 NSDHLQ15738 373 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 LILRA6Q6PI73 481 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 GALNT11Q8NCW6 608 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 MRGPRX3Q96LB0 322 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 DDOQ99489 341 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 ATF6BQ99941 703 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 AUNIPQ9H7T9 357 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 KLHL9Q9P2J3 617 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 CPNE7Q9UBL6 633 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 ABCA7Q8IZY2 2146 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 OR5K4A6NMS3 321 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 E9PI62 339 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 SOD1P00441 154 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 HEXBP07686 556 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF823P16415 610 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 ART1P52961 327 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 FXYD6P3P58550 94 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 BTN1A1Q13410 526 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 MCEMP1Q8IX19 187 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 FBLIM1Q8WUP2 373 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 GAL3ST3Q96A11 431 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 ULBP3Q9BZM4 244 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 TMEM185BQ9H7F4 350 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 SEC61A2Q9H9S3 476 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 ACTR10Q9NZ32 417 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 TBC1D29Q9UFV1 150 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 ERVK-19Q9WJR5 959 aa9.59□□□□□ -0.87
CTCFL-216ENST00000608263 CIB4A0PJX0 185 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 NPC1O15118 1278 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 SELENOFO60613 162 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 C1QBP02746 253 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 TNFRSF4P43489 277 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 ARHGDIBP52566 201 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 SGCBQ16585 318 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 TMEM196Q5HYL7 178 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 SLC35D2Q76EJ3 337 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF227Q86WZ6 799 aa9.58□□□□□ -0.88
CTCFL-216ENST00000608263 OR5J2Q8NH18 312 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms