RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 IFNGR2P38484 337 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 GSK3BP49841 420 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 CD81P60033 236 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 CARD16Q5EG05 197 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 RABL3Q5HYI8 236 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 FAM46DQ8NEK8 389 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 OR4K14Q8NGD5 310 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 FAM110BQ8TC76 370 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 CXorf40AQ8TE69 158 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 TFAP2CQ92754 450 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 RAB3CQ96E17 227 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 FOXN4Q96NZ1 517 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 STACQ99469 402 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 SLC38A3Q99624 504 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 FUNDC2Q9BWH2 189 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 LHPPQ9H008 270 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 ICKQ9UPZ9 632 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 CCL26Q9Y258 94 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 NOTCH4Q99466 2003 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 PLXNA2O75051 1894 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 DHRS12A0PJE2 317 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 CLEC18AA5D8T8 446 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 AGAP5A6NIR3 686 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 MOSPD3O75425 235 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 EBLN1P0CF75 366 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 G6PDP11413 515 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 MYF6P23409 242 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 SLC6A1P30531 599 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 MAGEA2P43356 314 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 SHC2P98077 582 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 TLE4Q04727 773 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 CLINT1Q14677 625 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 TTLL9Q3SXZ7 439 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 TTC23Q5W5X9 447 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 WDR88Q6ZMY6 472 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 VTCN1Q7Z7D3 282 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 TMEM25Q86YD3 366 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 CLEC18CQ8NCF0 446 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 TTC16Q8NEE8 873 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 OR4Q3Q8NH05 313 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 ASAH2Q9NR71 780 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 ASIC5Q9NY37 505 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 OPTCQ9UBM4 332 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 TRDCB7Z8K6 153 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 H3BQ06 376 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 SIAH2O43255 324 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 RGS10O43665 173 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 MPC2O95563 127 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 MT-ND5P03915 603 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 HLA-EP13747 358 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 NPR2P20594 1047 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 SERPINA2P20848 420 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 AOAHP28039 575 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 ID1P41134 155 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 GDF5P43026 501 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 RFX2P48378 723 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 SPINT3P49223 89 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 KHKP50053 298 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 CRYBA4P53673 196 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 DCDP81605 110 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 GUK1Q16774 197 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 XAF1Q6GPH4 301 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 SLC35D2Q76EJ3 337 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 KCTD9Q7L273 389 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 PRSS48Q7RTY5 328 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
HCG18-244ENST00000602516 OR5J2Q8NH18 312 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms