RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600393.1

FCHO1-233, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-233	ENST00000600393	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	CUBN	O60494	3623 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	CFAP73	A6NFT4	308 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	PDLIM1	O00151	329 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	GPRIN2	O60269	458 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	LY6H	O94772	140 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	AKR7A3	O95154	331 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	BCHE	P06276	602 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC1A3	P43003	542 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	MAGEA8	P43361	318 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	CEACAM7	Q14002	265 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	OR7A5	Q15622	319 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	CADM2	Q8N3J6	435 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM99	Q8N816	258 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	VPS33A	Q96AX1	596 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	DDIT4L	Q96D03	193 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	OR52B2	Q96RD2	323 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	ZBTB18	Q99592	522 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393		A0A096LNT2	108 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	LIPT2	A6NK58	231 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	RFXANK	O14593	260 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	GPR171	O14626	319 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	HDAC3	O15379	428 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	FRS3	O43559	492 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	DNPH1	O43598	174 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	IL7R	P16871	459 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	TTK	P33981	857 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	NUDT6	P53370	316 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC35A1	P78382	337 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	HOXC5	Q00444	222 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC17A1	Q14916	467 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	CMIP	Q8IY22	773 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF525	Q8N782	197 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	CDHR4	A6H8M9	788 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	KLF11	O14901	512 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF208	O43345	1280 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	NUDT7	P0C024	238 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	PTAFR	P25105	342 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	CRAT	P43155	626 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	HTR3A	P46098	478 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	FABP6	P51161	128 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	AGAP6	Q5VW22	663 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	SERPINA11	Q86U17	422 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	GPAT4	Q86UL3	456 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	MUC15	Q8N387	334 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	MUS81	Q96NY9	551 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	ADAM19	Q9H013	955 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	THAP1	Q9NVV9	213 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	UPB1	Q9UBR1	384 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	FAM234B	A2RU67	622 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	AQP7P3	A6NL99	342 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FCHO1-233	ENST00000600393	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		11.28	□□□□□ -0.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms