RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580357.1

IFT20-210, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 3

Gene IFT20, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-210ENST00000580357 CPOXP36551 454 aa14.62□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 H3F3AP84243 136 aa14.62□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 FAM27E3Q08E93 113 aa14.62□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.62□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.62□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.62□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 SMYD1Q8NB12 490 aa14.62□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 OR2T12Q8NG77 320 aa14.62□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 PROX1Q92786 737 aa14.62□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 SLC38A4Q969I6 547 aa14.62□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.62□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 OR10A4Q9H209 315 aa14.62□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 CRIM1Q9NZV1 1036 aa14.62□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 LIPT2A6NK58 231 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 FRS3O43559 492 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 VAMP5O95183 116 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 IMPDH2P12268 514 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 PPP3CBP16298 524 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 SLC16A1P53985 500 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 HOXC5Q00444 222 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 CEACAM7Q14002 265 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 OR1Q1Q15612 314 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 NRF1Q16656 503 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 ALG10BQ5I7T1 473 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 C1orf140Q5VVS0 124 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 ZNF613Q6PF04 617 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 TREML1Q86YW5 311 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 SLC15A3Q8IY34 581 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 MICU2Q8IYU8 434 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 ARHGDIGQ99819 225 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.61□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 CENPEQ02224 2701 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 A0A1B0GWA3 101 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 SH3D21A4FU49 640 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 NPIPB7O75200 414 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 AHSA1O95433 338 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 KDELR2P33947 212 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 UGT2B10P36537 528 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 BNIP2Q12982 314 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 MFSD13AQ14CX5 517 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 P2RY6Q15077 328 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 TMEM225Q6GV28 225 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 OR6S1Q8NH40 331 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 LINC01560Q8TB33 94 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 EPYCQ99645 322 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 MCHR1Q99705 422 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 C12orf49Q9H741 205 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 CMTM6Q9NX76 183 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 ZNF226Q9NYT6 803 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 EDARQ9UNE0 448 aa14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 A0A087WUJ7 227 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 FAM221AA4D161 298 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 FAM107AO95990 144 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 OPN1SWP03999 348 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 CD247P20963 164 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 HTR2AP28223 471 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 OR3A2P47893 321 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 NUDT2P50583 147 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 MNAT1P51948 309 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 OR7A5Q15622 319 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 GPR32P1Q8NGA4 272 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 RNF217Q8TC41 542 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 LZICQ8WZA0 190 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 TAMM41Q96BW9 452 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 KLHL4Q9C0H6 718 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 CELSR2Q9HCU4 2923 aa14.59□□□□□ -0.07
IFT20-210ENST00000580357 A0A0B4J2E0 115 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-210ENST00000580357 A0A1B0GX12 115 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-210ENST00000580357 AQP7P3A6NL99 342 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-210ENST00000580357 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-210ENST00000580357 A6NNC1 897 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-210ENST00000580357 ZNF716A6NP11 495 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-210ENST00000580357 GSTA4O15217 222 aa14.58□□□□□ -0.08
IFT20-210ENST00000580357 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
IFT20-210ENST00000580357 CTAG2O75638 210 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms