RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 NICN1Q9BSH3 213 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 UBQLN4Q9NRR5 601 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 CDHR4A6H8M9 788 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 OPRD1P41143 372 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 RPP30P78346 268 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 CTBSQ01459 385 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 TBPL2Q6SJ96 375 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 LACC1Q8IV20 430 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 RGPD2P0DJD1 1756 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 CDC14CA4D256 554 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 CA3P07451 260 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 GNB3P16520 340 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 GPR155Q7Z3F1 870 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 ZFAND1Q8TCF1 268 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 ADAM29Q9UKF5 820 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 HLA-FP30511 346 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 CLDN6P56747 220 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 ALKAL1Q6UXT8 129 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 BPIFB2Q8N4F0 458 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SLC38A5Q8WUX1 472 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SDSLQ96GA7 329 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SNX18Q96RF0 628 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 COX15Q7KZN9 410 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 BBS1Q8NFJ9 593 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD34BA5PLL1 514 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 HHLA1C9JL84 531 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 RPE65Q16518 533 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 DUSP7Q16829 419 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SLC39A13Q96H72 371 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 HHIPQ96QV1 700 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SLC6A20Q9NP91 592 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 C1GALT1Q9NS00 363 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 TAS2R16Q9NYV7 291 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 PTHP01270 115 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 TNK1Q13470 666 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 ZFP82Q8N141 532 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 RSC1A1Q92681 617 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 GDE1Q9NZC3 331 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0D9SG52 128 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SCG5P05408 212 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 STEAP3Q658P3 488 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 OR5M10Q6IEU7 315 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
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PTPRM-211ENST00000580170 PLGLAQ15195 96 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 PLK5Q496M5 336 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 RTL6Q6ICC9 239 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 LMAN1LQ9HAT1 526 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SIAEQ9HAT2 523 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 EHFQ9NZC4 300 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 LUZP4Q9P127 313 aa19.88■□□□□ 0.77
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PTPRM-211ENST00000580170 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 C5P01031 1676 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 B4DXG7 233 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 EFNA3P52797 238 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 NR0B2Q15466 257 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 OR10K1Q8NGX5 313 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 HOXB5P09067 269 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 DEFB103AP81534 67 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM41BQ5BJD5 291 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 OR9K2Q8NGE7 335 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM23P36406 574 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 UBE2KP61086 200 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 CAMK2DQ13557 499 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP19.87■□□□□ 0.771e-8■■■■■ 37.2
PTPRM-211ENST00000580170 MOB3CQ70IA8 216 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 ENTHD1Q8IYW4 607 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 BORCS7Q96B45 105 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 MED17Q9NVC6 651 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 MPPED1O15442 326 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 FABP7O15540 132 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 IGHG1P01857 330 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRM-211ENST00000580170 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa19.87■□□□□ 0.77
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